在历史上最早称为“英祢”，并设有“英祢院”的庄园，并由平家一族的神崎太郎负责管理，并称为“英祢氏”。镰仓时代改为“莫祢氏”，地名也跟着改为“莫祢”。直到1451年设置萨州岛津家时，再将莫祢的地名改为现今的“阿久根”。

1889年04月01日：实施町村制，设置出水郡阿久根村、下出水村。

1924年04月01日：下出水村改名为三笠村。

1925年01月01日：阿久根村改制为阿久根町。

1949年04月01日：三笠村的部份区域分村为江内村（现已并入出水市）。

1952年04月01日：阿久根町改制为阿久根市。

1953年05月03日：三笠村改制为三笠町。

1955年04月10日：三笠町被并入阿久根市。