阿丰索三世是葡萄牙国王阿丰索二世的幼子，母亲为卡斯蒂利亚公主乌拉卡。他年轻时代的大部分时间在法国度过。1238年，他与布洛涅伯国的女继承人玛蒂尔达结婚，因此继承了布洛涅伯爵的爵位。1246年，阿丰索的兄弟、葡萄牙国王桑舒二世与教会发生严重冲突。教皇英诺森四世宣布废黜桑舒二世，并指定阿丰索取代其地位。阿丰索没有拒绝教皇的好意，他立刻返回葡萄牙进行与桑舒二世的斗争。他与桑舒二世进行了两年的封建混战，最终于1248年推翻后者夺取了王位。为了登上葡萄牙王位，阿丰索三世放弃了布洛涅伯国，更在1253年与玛蒂尔达离婚。他接着娶了卡斯蒂利亚国王阿方索十世的私生女比阿特丽斯为王后。1250年至1251年期间，阿丰索三世征服了葡萄牙境内的最后一个摩尔人王国阿尔加维，完成了葡萄牙的收复失地运动。