相传千年龙的龙骨可制成长生不老药，所以坏人们都想得到这一传说中的动物。少女阿碧丝偶然地发现了一头老千年龙，和它成为了好朋友。所以，她被想得到龙骨的海军抓去了，海军逼她说出千年龙的下落，她为了保护千年龙拼死逃出了海军船，开着小船逃到了海上。当她正要在海上迷路的时候，主角路飞偶然地把她救到了船上。于是，草帽一伙把她送回她的故乡军舰岛。在军舰岛的隐秘山洞里，草帽一伙也发现了千年龙真实存在的秘密，并帮助她一起保护千年龙。