更新时间：2024-10-13 10:18
1911年10月由江苏布政使任上调任山西巡抚。10月6日到达太原。仅仅四天之后，武昌起义爆发。十一天之后，长沙、西安同日宣布独立，脱离满清政府。这个时候，北京的满清权贵、皇亲国戚忙着把资产转移到外国银行，仅庆亲王就转移了几百万大洋，以至于银行纷纷破产。达官显贵纷纷忙着逃难，而刚到山西的陆钟琦却不识时务的企图挽救行将就木的满清朝廷。陆钟琦大概意识到山西新军已经被革命党所掌握，于是以防止陕西起义军东渡黄河为由，派新军八十五标离开太原开往晋南。同时，调大同的旧军来太原守卫军火库等要害部门。为了防止新军起义抢夺军火库的武器弹药，陆钟琦还下令将库存的三千支新式步枪连同子弹调往河南。但他的这些措施没能阻挡山西新军起义，而是促进了起义。后来，发动起义的阎锡山将陆钟琦的措施概括为“运枪开兵”。当控制着新军的中国同盟会会员得知陆钟琦要运枪到河南的消息，就断然决定提前发动起义。1911年10月29日早晨，起义新军士兵持枪冲入巡抚衙门，阎锡山质问陆钟琦是否参加起义，陆钟琦顽固拒绝，阎锡山当即下令将陆钟琦乱枪击毙。从陆钟琦就任山西巡抚，到被击毙仅仅二十三天。伯夷、叔齐式的恪守，注定了陆钟琦的悲剧下场。
根据阎锡山日后的回忆，起义士兵冲进巡抚衙门时，陆钟琦“衣冠整齐，立于三堂楼前，陆公子随其旁”。这位陆公子，是陆钟琦的长子陆光熙，在北京担任翰林院编修，曾经在日本学习军事，与阎锡山还是军校同学。
陆光熙告诉起义士兵：“你们不要开枪，我们可以商量。”但是，陆钟琦却说：“不要，你们照我打罢。”而这时，“因巡抚之随侍有开枪者，遂引起革命军枪火，陆钟琦与其公子均被乱枪击毙”。
根据阎锡山的说法，因“巡抚之随侍”率先开枪，而导致双方交火，陆钟琦父子被击毙。阎锡山日后也表白，起义之前，他再三“告知两标（参与起义的部队）对陆巡抚及其公子暂囚勿伤。”
而根据《清史稿》的记载，陆钟琦面对涌进来的起义士兵，痛斥道：“尔辈将反邪？”话音未落即被当场击毙。陆光熙奔出援救，也被击毙。
陆家父子被击毙后，起义者冲进了内室，陆钟琦的妻子唐氏、仆役万春先后被击毙，陆钟琦13岁的长孙陆鼎元也被刺伤。有关唐氏的死，《清史稿》说她“抱雏孙起，并遇害。”
巡抚衙门内，还住着陆钟琦的三个儿媳妇及其子女们。枪声响起后，她们在仆人们的帮助下，在衙署东跨院的东墙上挖了一个洞，成功逃脱。这段可怕的经历，令陆氏后人终身远离政治。陆钟琦有位孙女陆士嘉日后非常著名，曾在二战时留学德国，成为航空专家，参与创建了北京航空学院（今北京航空航天大学），但其终身难以摆脱家族这段血腥历史的阴影。
至于陆钟琦的仆人、警卫等，究竟有多少人在起义当晚被击毙，并无任何资料记载。可以肯定的是，巡抚衙门里的人，无论是陆钟琦的亲属还是下属，没能逃走的，全部被击毙。
陆钟琦被击毙的具体细节，已经难以还原，可以肯定的是，一、他丝毫没有表露过求饶或悔过的意思；二、起义者也没有如同别的省份那样，表达任何拥戴他担任起义领导人的意思。阎锡山日后说得很清楚：“他们（陆家父子）与我们的立场”是不同的，太原起义自始至终都没有想过要拥立陆钟琦。
除了陆氏一门被击毙外，起义士兵们的上司混成协协统谭振德因持枪反抗，也被士兵们乱枪击毙。山西新军番号为暂编陆军第43协（旅），下属4500余人，驻扎在太原周围。另有旧军4000余人，分驻全省各地，守卫太原的不足700人。因此，谭振德实际上就是山西驻军最高长官。第43协又分第85、86两标（团），标统分别是黄国梁和阎锡山，两人是结拜兄弟。吊诡的是，阎锡山是革命党，其手下3个营，有2个营的管带（营长）也是革命党；黄国梁及其手下的3个营长，没有一个是革命党，却在革命党的动员下，首先发动了太原起义，充当了革命的先锋。
与陆钟琦一样，谭振德不愿意革命，除了死路之外别无出路。《清史稿》记载说，谭振德在起义者攻击巡抚衙门之前就被击毙，也有记载说他被击毙于陆钟琦之后。一场起义下来，太原城内死了不少人，除了交战而死的士兵之外，清朝溃兵们完全失去纪律，在全城烧杀抢掠，也死了不少人，而阎锡山为了恢复秩序，大开杀戒整顿军纪，又就地正法了数百名清朝乱兵。
对于被击毙的陆钟琦父子及谭振德，阎锡山以优礼厚葬，他在回忆录中说：“他们与我们的立场虽异，而他们忠勇孝的精神与人格则值得我们敬佩，因立场是各别的，人格是共同的，故我对他们的尸体均葬之。”