陈于陛，邯郸市曲周县堤上村人。出身于农家，勤而好学。嘉靖三十八年进士及第，一开始担任庆阳（在甘肃省）推官，礼部主事等职。嘉靖年间，皇帝为给太子朱载坖（后为帝，年号隆庆）选择东宫讲官（太子的老师），召集群臣商议，大臣们一致认为陈于陛品学兼优，道德文章俱佳，为第一人选，于是嘉靖帝便封陈于陛为翰林待诏，东宫讲官，教太子读书。由于陈于陛克尽职守，教育有方，因此深受隆庆皇帝赏识。

张居正败落后，陈于陛二次出山，任右副都御史，陪祀皇陵，后升任少司空，督修京城，在施工中他精打细算，计划周密，堵塞漏洞，保质保量提前竣工，并节约五万余金，受至皇帝奖赏，再次晋升为左司马总督漕运，并巡抚凤阳。在任内，他整顿了漕政，保证了大运河的畅通，成绩甚大，个人应得例金十三万，但他不贪钱财，将其一半救济了贫生，一半送给养济院。由于陈于陛德高望重，晋为户部尚书，后病故于任上。陈于陛从不居功自傲，大力提掖后进，对德才兼备的青年甚为器重，经他推荐提拔的不下数十人，同乡张师孟很有才干，但家贫穷，陈于陛经常周济，亲加教诲，后中进士，官至太仆寺少卿，为一代名臣。