1924年10月第二次直奉战争爆发，冯玉祥回师北京发动政变，曹锟、吴佩孚兵溃失势。11月17日，陈调元拥护齐燮元领衔通电称：“在武昌组织护宪军政府，不承认冯玉祥回北京后所发命令。”此时此时，奉军乘机大举入关，张宗昌的第二军为先锋部队南下。陈调元见直系势蹶，江苏政局难支，自己孤守徐州势难招架，即派员暗通张宗昌。有人报知齐燮元，齐半信半疑，即电陈赴宁开会。陈见齐生疑，便伪称辞职：“调元承巡帅知遇，畀以重任，矢志不辞劳怨，忠于巡帅，忠于团体。奈自愧愚直，不善逢迎权贵，致遭嫉视，只有退位避职，另让贤能。”声泪俱下。齐半疑之心顿释，备加劝慰，促其速返徐州坐镇。

1925年春，张宗昌军抵达徐州边境，陈调元当即率部撤出徐州，退至砀山、萧县一带。5月，陈降奉军，所部扩编为第六师，陈任师长。

7月，张作霖任命杨宇霆为江苏军务督办，委陈为军务帮办。但奉军高级军官对陈多有歧视，苏督杨宇霆曾下令陈的车子不准直入督署，陈“必须在门口下车”。陈羞愧难忍，对友人哭诉：“我小名也是帮办，这种态度叫人何以忍受！”9月，浙江督办孙传芳密派幕僚杨文恺赴南京，说陈反奉，“许于战胜之后优予酬报”。陈与杨文恺一拍即合。10月初，孙传芳举兵向松江、上海进攻，奉军邢士廉师一触即溃。陈闻孙在上海得手，立即在南京动作策应。一日，陈设宴召请督署参谋长臧式毅和奉军师长丁喜春以及团营长们，正在酒酣之时，陈的部队突然冲入，不废一弹，俘获臧式毅、丁喜春及所有在场的军官。16日，陈迎孙军进入南京，孙传芳委陈调元为第八军军长，率兵过江进击奉军，相持在宿县一带。11月5日，孙传芳在南京宣布成立浙赣闽苏皖五省联军总司令部，自任总司令，任命陈为皖军总司令。陈调元把皖系倪（嗣冲）军的五个旅逐步并为己有，军势大增，一时成为直系军阀中引人注目的风云人物。

1926年7月，国民革命军挥师北伐，进占湘、鄂，挺进江西。孙传芳急命陈为第五方面军总指挥，出兵赣西堵击北伐军。陈在蚌埠接任新职，于出兵前夕，将新近逮捕的共产党员杨兆成绑赴军前杀害“祭旗”。11月，驻合肥北乡的一部分地方军队举行武装起义；接着，六安、霍邱、太湖的民军暴动；防守九江的周凤岐第三师又哗变倒戈。陈调元急忙撤军，分兵镇压。与此同时，陈以“讨赤”为名，派兵镇压开展革命活动的省教育会和第一师范学校的师生，封闭安庆政法专科学校，捣毁《通俗教育报》社。不久，江西的孙军全军覆没，福建亦为北伐军所占，浙江告急，孙传芳投奔张作霖，亲赴天津密商抗御北伐军事宜。12月6日，陈调元迎张宗昌率直鲁军南下，并向张表示，愿将津浦路南段收入、浦徐货捐、凤阳关税、正阳关与芜湖港盐厘、两淮盐款等悉交鲁军筹饷。同日，安庆数万人聚会，声讨“孙传芳擅委皖军总司令、省长，实行征服政策，宰割安徽，蹂躏皖人”，并决议“电告陈调元、王普（省长），请勿轻率从事”。陈调元通令缉拿大会组织者王亚樵等。陈调元通令缉拿大会组织者王亚樵等，镇压“闹事”者，把大批进步工人、学生投进监狱。21日，孙传芳、陈调元与张宗昌在南京会商，决定以陈调元部在皖境沿江防御国民革命军东下，直鲁军由皖进攻九江，孙传芳以全力对浙。议毕，陈返安庆布置。

此时，北伐军分路进击，迫近皖南地区，孙传芳频频电令陈调元急速出兵皖南。陈看到北伐军势不可挡，孙军已是强弩之末，奉鲁军不可信赖，乃暗派师长范熙绩去武汉向北伐军输诚。孙见陈不听号令，疑其有变，派人送去20万元，以为笼络，并召陈赴南京议事。陈到达南京后，孙一面笑脸款待，一面电令驻大通的第十一旅旅长孙东云接替陈职。陈调元早有戒备，知情后立即潜赴下关，乘兵舰直驶安庆。1927年3月5日，陈调元乘舰行至芜湖，宣布就任国民革命军第三十七军军长兼北路总指挥。3月9日，陈乘舰至安庆，但所部第一混成旅哗变，陈闻讯不敢登岸，即赴九江与蒋介石会商军事。蒋派王天培率第十军协助陈攻入安庆。不久，陈统兵三个师由芜湖渡江袭击津浦路鲁军侧面。

4月12日蒋介石发动“清党”反共政变，随即在南京建立国民政府，陈调元奉行蒋介石“清党”反共的命令，在安庆等地逮捕、杀害共产党人和各界进步人士，白色恐怖笼罩安徽。

8月，孙传芳利用国民党新军阀内部分裂的混乱局面，分兵三路渡江，在栖霞、龙潭一线与国民党军展开激战，陈调元伏兵乌衣，狙击孙军。11月，陈被任命为安徽省主席。1928年4月，蒋介石会同冯玉祥、阎锡山、李宗仁的兵力，向以张作霖为首的旧军阀发动总攻击，陈调元任第一集团军第二军团总指挥，担任津浦路正面攻击。陈部先是扼守青山关、莱芜口，击溃鲁军杜凤举部后，乘胜追击，沿吴桥、南皮、沧州一线前进。蒋介石到北京后，即宣布要实行“裁军建设”，召开编遣会议，以削弱其他派系的军队，扩充自己的实力，与冯玉祥等人出现新的矛盾。陈调元唯蒋之马首是瞻，欣然奉命把所部缩编成第四十六师，驻兵安徽，渐得蒋之信任。

1929年4月，日本在济南一线的驻军定期撤回，冯军孙良诚部前往接防。蒋介石唯恐冯军占有青岛海口，与己不利，抢先宣布陈调元为接收青岛之中央特派员，同时“密电日军，暂缓撤退”。。5月，蒋任命陈调元为山东省主席。10月，冯玉祥誓师讨蒋，兵分八路南下。蒋介石调兵遣将抗拒冯军，委陈调元为“总预备队军团总指挥”。翌年5月，冯玉祥与阎锡山联合一线，共誓讨蒋，中原大战揭开战幕。初战，冯军连克数城，攻势猛烈。蒋介石在柳河召开军事会议部署退却，陈调元却在会上力主反攻，并自告奋勇，愿从右翼攻冯，以分陇海线晋军兵力。蒋立即任命陈为右翼军总指挥，参与鲁西考城战役，击退石友三部；接着，孙殿英军溃退，梁冠英、张印湘等通电附和，蒋军颓势得以扭转。9月，张学良通电拥蒋，率兵进关，战局急转直下。11月，蒋再次任命陈调元为安徽省主席。

蒋介石在战胜冯、阎之后，即向工农红军接连发动了五次军事“围剿”。陈调元竭力奉行蒋的“剿共”部署，不断派兵进攻鄂豫皖红军根据地。1930年12月，陈派兵从六安、苏家埠、霍山三路出击，对红军根据地发动“围剿”。1931年2月，陈再次调集军队，进攻苏区，直扑金家寨（即今金寨县），“枪杀群众一万七千多人”，然后占领麻埠、独山、诸佛庵。与此同时，陈加强在安徽全境的反动统治。同年4月，中共安徽省委代理书记王步文等13名共产党人被捕，陈下令组织特别法庭，亲自审讯，先以高官厚禄劝降，继而施加电刑、火烙等种种酷刑，最后下令将王步文等在安庆杀害。

陈调元在安徽为弥补军费之不足，强行勒征米盐捐税，公开贩卖鸦片，遭到安徽人民的反对。1931年春，安徽各界民众组织请愿团，赴南京向当局控诉，列举陈在安徽强征米盐捐、勒民种烟公开买卖的事实，呼吁：“请免陈职，以苏民困。”5月31日，陈被迫电蒋“请求辞职”，承认自己“政治无办法”。6月，蒋任刘镇华为安徽省主席，以平息安徽民愤；另委陈以国民政府委员的虚衔。1934年1月，蒋在第五次“围剿”工农红军时，任命陈为赣粤闽湘鄂五省“剿匪”预备军总司令。同年12月，陈出任军事参议院院长。

陈调元到南京后，成为蒋介石的高级幕僚。1936年秋，随蒋去西安视察。西安事变时，陈调元与陈诚等同被拘禁。此后，陈调元长期患病，抗战时随政府内迁，辗转至武汉、重庆，未再担任实职。1943年12月18日，病死在重庆北碚寓中。

表格参考资料来源：

陈调元庄园位于陈调元故里安新县同口村北。地基原为水坑，1904年填平，1921年春开工建设，1922年冬竣工。占地4371平方米，建筑面积2618.5平方米，共有房屋46间，三进式四合院组成。大门设在东南角，各院落正房均为硬山顶，施柱前廊，各屋之间回廊相通。厢房墙体为清磨砖对缝，木结构屋梁，瓦顶，冰盘檐，方格玻璃窗，内外两层。第三进四合院有正房九间，东头两间隔成里外屋，里屋为机要室，并设地下室。整体建筑结构紧凑，布局合理，建造细腻。庄园落成后，1935年陈调元曾回家暂居，以后由他人代管。新中国成立后一段时期当作学校，部分房屋住村民。2001年被列为河北省文物保护单位。