隐翼木科的学名Crypteroniaceae由模式属隐翼木属学名Crypteronia的复合形式Crypteroni-加上表示科的等级后缀-aceae构成。该词为复数形式，故在做主语时应与动词的复数形式搭配。

本科中文名亦由模式属中文名“隐翼木属”中的专名“隐翼木”加上“科”字构成。其单纯的中文别名有隐翼科，详见隐翼木属条目的“词源”一节。