玩家在游戏中可获得的道具分为提示金币与证物。

提示金币是一类消耗品，玩家的初始金币数为30，而每个可供调查的场景都隐藏着3枚金币。在玩家解答谜题的途中，如果碰到了不知该如何是好的情况时，可通过至少消耗1枚金币来获得谜题的提示。金币的数量是有限的，玩家在使用时应该慎重进行思考。

至于证物，玩家在游戏中主要是通过法庭审理与场景探索来获得的，此过程中玩家身上的证物档案与人物档案有时也会自动更新。在与证人对话时，如果玩家出示了对应的证物或人物，还能够解锁新的对话、获得新的线索。另外，游戏还会根据章节的推进自动清空相应的证物资料。

玩家在游戏中的活动地点为充满谜团的迷宫城以及其中的法庭。随着剧情的推进，玩家不仅要在城市四处与居民们进行对话与解谜、在法庭上与检察士进行辩论与探讨案件，而且还需要到各处进行调查取证，从而寻找能够在法庭上发挥用处的证物。

在调查部分，玩家可通过对各处进行调查来寻找相关线索，玩家可探索的场所会通过剧情推动以来解锁。此外，现场也会出现各种相关的NPC。通过对话和进行解谜，玩家可从他们那里获得新的情报，已经选择过的对话会在话题前以“√”表示已询问。而通过点击场景中的某些物品，玩家还能够获得提示金币，但每个场景只有3枚。

注：图上的黄色文字为庭审时的操作方法

游戏流程通过雷顿教授的“冒险部分”与成步堂的“审判部分”的交互操作展开。

游戏的DLC分为2种，分为“特别章节+解谜”“特别画廊”，每种DLC各12回，于2012年12月12日起连续24周的每个周三免费发布，各种类型的DLC每周交替发布，全24回。

第一片尾主题曲：DENOUEMENT

第二片尾主题曲：PRELUDE

因为是交替体验《雷顿教授》与《逆转裁判》的游戏系统，所以玩家在游玩时所感受到的惊讶感会变得平淡。不过玩家在解谜时的闪现与在庭审时揭露矛盾后所获得的那份畅快感是值得品味的，而且游戏中能够让玩家的情绪高涨起来的演出也十分优秀。《雷顿教授》与《逆转裁判》本身就是两个方向性不同的游戏，但由于《雷顿教授VS逆转裁判》的世界设定与剧本的巧妙，玩家因此能够毫无违和感地进行游玩，这一点也是它厉害的部分。作为游戏主要内容的“谜题”与剧情的紧密贴合能够让人更深刻地感受到游戏的世界观，而在魔女审判中“追问”证言中的证人之外的对象这一要素也很欢乐。游戏有效地运用3D表现的演出增强了玩家的临场感，登场人物的滑稽动作与台词也很不错。还有一点的，就是因游戏设定而产生的“魔女审判”继承了《逆转裁判》系列的醍醐味、增强了与复数的证人进行辩论时的乐趣。（Fami通 评）

《雷顿教授VS逆转裁判》是一款幻想风的“杀必死”游戏，不过玩法风格上的搭配不够理想。它有着异想天开的杀必死内容、奇妙的画风和音效以及有趣的台词，但令人失望的剧情与被弱化的挑战则是它的缺点所在。总体而言，它很照顾粉丝的感受，但却没有充分发挥《雷顿教授》与《逆转裁判》这两个系列应有的潜能。（IGN 评）