青海藏医药文化博物馆占地面积200亩，建筑面积1.2万平方米，布局整体建筑坐南朝北，系框架式砖混两层歇山顶仿古建筑，馆舍主体分三层，共有展厅8个；一、二层设有藏医史、曼唐器械、古籍文献、藏药标本、天文历算、彩绘大观等六大展厅；负一层建有班智达藏艺展销精品城。主楼一层为民俗文物展厅和文物库房，二层为历史文物展厅、电子监控室和值班室。底层5500平方米，为陈列展厅、卖场、文物库房和办公区；二、三层各为3200平方米，为陈列展览厅：楼顶设有千佛殿，面积为300平方米。各大展厅根据不同的展示内容，通过环境再现、唐卡雕塑、文物展示、高科技模拟等方式和手法，突出特点，各具风格，展示了中国藏医药文化博大精深的丰富内涵。

藏医史展厅通过对藏医药学发展的七个历史时期，28位历代著名藏医药学家的事迹、塑像和名著的介绍，勾勒出藏医药发展的历史轨迹，向人们介绍了作为世界医学宝库中的一朵奇葩——藏医药的历史和医药文献。并通过一位位医生和他们对疾病的治疗方法，展示了作为世界四大传统医学之一的藏医史绚丽多彩的画卷。

曼唐器械展厅展出的80幅唐卡，在世界医药学史上亦属罕见。通过这些唐卡和传统藏医使用的180多件外科手术器械，介绍了藏医药学理论及其实践技术。这种独创的、以画卷形式进行医药教学的挂图和1300多年来使用的医疗器械，再现了2000多年前藏医就已广泛应用于临床实践的外科手术。以照片的形式，介绍了数千年前藏医就进行过的穿颅术，不仅显示了藏族先民的聪明和智慧，也充分证明了较高的藏医学外科手术技术。

古籍文献展厅陈列了藏医药文献中最具代表性的1000多函典籍，还展出了300多部现当代藏医药学书籍和古籍印版。通过古籍印板，《四部医典》、《月王药诊》、《祖先口述》、《四部医典蓝琉璃》、《晶珠本草》等著名典籍，显示了作为世界四大传统医学之一的藏医药学浩瀚的典籍和博大精深、体系完整的藏医药学理论。数百部现当代藏医药学书籍展示了古老的藏医药学理论研究后继有人。

藏药标本展厅展出有2000多件分布在青藏高原的动物、植物、矿物标本，其中有利用汞、金、银等原料经特殊工艺炮制而成的、被誉为“甘露精华之王”的“佐太”。还有已收入国家药物基本目录、受国家中药保护品种的七十味珍珠丸、仁青常觉等成品药。展厅不但展示了藏药学名著《晶珠本草》中所收载药物中的精品，而且也成了高原生物学的一个展示课堂。一件件标本、一幅幅照片，展现了世界第三极——青藏高原特殊的自然环境中生机勃勃的药物生长环境。

天文历算展厅采用沙制时轮坛城、天文历算工具、古籍、唐卡、历代有突出贡献的藏历算学家雕像和现代化科技手段，再现场景复原和模拟藏族历算的日月星辰运行状况，演示它在藏历推算、天气预报、测定方位等方面作用与推算方法。天文历算学是藏民族的祖先在长期的生产、生活实践中总结出来的一门自然科学，是藏族文化的重要组成部分。它历史悠久，文献丰富，并有鲜明的民族特色，在藏族人民的实际生活中应用范围很广，对藏族地区的农牧业产生了重要的影响。天文历算同藏医药学有着直接关系，藏民族通过长期实践，得出“有算必有药，有药必有算”的辩证说法，如通过掌握外界气候变化、五行运行规律，来进行疾病的诊断、治疗，药材的采集、炮制等。

彩绘大观展厅展出有荣获“大世界吉尼斯之最”证书、并受国家版权保护的《中国藏族彩绘大观》。《中国藏族彩绘大观》长达618米、画面达1500平方米，上有唐卡700多幅，不同的堆绣图案3000多种，内容博大精深，其中包括藏族对宇宙形成的认识、历史、宗教、医学、文化生活等诸方面，堪称藏族文化的百科全书。《中国藏族彩绘大观》从策划到完成历时长达27年，由青、藏、甘、川、滇五省区四百多位藏、蒙、土、汉学者、专家、顶尖工艺美术师，采用纯天然绘画颜料，以藏族传统艺术绘画技法绘制而成。

青海藏医药文化博物馆整个建筑气势宏伟，昂扬大气，内涵深邃，借用天圆地方的理念，融藏族传统建筑风格与现代建筑艺术于一体，在周围建筑物与园区广场的衬托下，成为生物产业园区统一和谐的标志性建筑，不但具备浓郁的藏民族文化艺术特色，又兼有现代先进的建筑手法和科技含量，再加上各种文化艺术精品陈列其间，更使每一位参观者有身处藏民族艺术文化殿堂的感觉。

青海藏医药文化博物馆馆内藏品来源包括捐赠，收购，采集等；馆内藏品类别包括棉质、皮质、石质、纸质、金属等。据中国博物馆志显示，青海藏医药文化博物馆馆内藏品达20000件/张。截至2019年末，馆内藏品数量达50000件/套，珍贵文物1020件/套。

《中国藏族艺术彩绘大观》长618米、画面达1500平方米，内容囊括藏族对宇宙的认识、青藏高原的形成、天文、地理、历史、宗教、医学、民俗、文化艺术、生活等诸方面，堪称藏族文化的百科全书。该展品荣获吉尼斯世界纪录，并受国家版权保护，为青海藏医药文化博物馆镇馆之宝。

《四部医典》采用非物质文化遗产传统制作工艺制成，长2米，宽1.2米，重达1.5吨，是目前世界上最大的一部《四部医典》。

《青海工运》、《西宁经济开发区》对青海藏医药文化博物馆进行了报道，尤其《西宁经济开发区》开设专栏，连续对该馆展品进行宣传。

2006年5月，青海藏医药文化博物馆参加“中国夏都药品药材博览会”。

2006年至2008年度，青海藏医药文化博物馆参加在西宁举行的“中国青海结构调整暨投资贸易洽谈会”。

2007年5月，青海藏医药文化博物馆参加了在西宁市城南新区国际会展中心举行的“2007年青藏高原中藏药材药品保健品交易博览会暨青海地方名优特色产品展销会”；同年10月，参加2007年“肯尼亚中国生物医药产品展览会”。

2008年3月，青海藏医药文化博物馆参加由青海省委省政府组织的“2008大美青海香港行活动”；同年4月1日，青海藏医药文化博物馆参加由省政府承办、省文化厅组织实施的北京2008年奥运会奥林匹克公园中心区“中国故事”青海文化展示活动。

2009年7月31日，青海藏医药文化博物馆在国际人类学与民族学联合会第十届大会上，被授予会展组最佳组织奖。

2009年2月10日，青海藏医药文化博物馆被批准为青海省级文化产业示范基地。

2009年5月21日，青海藏医药文化博物馆被中宣部批准为全国爱国主义教育基地。

2009年6月15日，青海藏医药文化博物馆被批准为青海省藏医药技艺传习所。

2018年4月11日，在2018中国西北旅游营销大会暨旅游装备展上，青海藏医药文化博物馆入围“神奇西北100景”榜单。

2018年9月，经中国博物馆协会决定同意青海藏医药文化博物馆为国家二级博物馆。

2019年11月，《国家级非物质文化遗产代表性项目保护单位名单》公布，青海藏医药文化博物馆获得“藏族鎏钴技艺”保护单位资格。

2020年12月，青海藏医药文化博物馆入选第四批国家一级博物馆名单。

2022年11月，被命名为“2021-2025年度第一批补充认定的全国科普教育基地”。

青海藏医药文化博物馆历任馆长为艾措千（2006.9—）；元旦尖措（2006.9—，副馆长）。

青海藏医药文化博物馆单位性质是民办非营利企业。

青海藏医药文化博物馆经费来源是自筹和政府补贴。

青海藏医药文化博物馆机构设置有行政部、宣教部、陈列部、后勒部、营销部。

青海藏医药文化博物馆有职工79人；全部实行合同聘用制。

截至2019年末，青海藏医药文化博物馆年参观人数达61万人次。

青海藏医药文化博物馆位于青海省西宁市生物产业园区经二路36号。

青海藏医药文化博物馆开放时间为夏季9:00—18:00，冬季9:00—17:00，节假日不休息。

《彩绘大观》展厅特展门票为60元/人。学生30元/人；老年人10元/人；军人（有警官证者）、残疾人30元/人。其他展馆全部免费。

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