韦珍出身自关中望族京兆韦氏东眷，幼时就有志气和节操。初任京兆王元子推常侍，后任尚书南部郎。北魏孝文帝初期，蛮地首领桓诞归附，朝廷考虑到安抚边地的策略，以桓诞为东荆州刺史。令韦珍为使者，与桓诞一道招安抚慰东部的蛮人。韦珍从悬瓠向西行进三百余里，到达桐柏山，直到淮水之源，宣扬朝廷的恩泽，所到之处莫不降附。淮水的源头有一座古旧的祠堂，蛮人风俗，长期以来都用活人来祭祀。韦珍就晓谕当地百姓说：“天地神灵，就是人民的父母，哪里有父母要吃子女的肉的呢！从今以后，都应当用酒肉代替人祭。”当地蛮人遵从他的规定，从此都照这样办。韦珍在这一带总共招降了七万余户，为他们设置郡县然后返回朝廷。因奉使宣称圣旨有功，被授予左将军、乐陵镇将之职，赐爵为霸城子。

南齐司州民谢天盖自命为司州刺史，图谋以司州归附于北魏。事情泄露之后，被萧道成的部将崔慧景围攻。孝文帝拓跋宏令韦珍率所在镇的兵马渡过淮水援助接应。当时萧道成听说韦珍率军将要到来，就派部将苟元宾凭据淮水进行抵御。韦珍就分派一支骑兵，在淮水上游偷渡，自己率领步卒与敌军接战。两军旗鼓刚刚相交，北魏骑兵突然杀来，南齐军被两面夹击，大败。谢天盖被他身边的人所杀，余部投降南齐将领崔慧景。韦珍乘胜奔驰前进，又打败了崔慧景，把降附的民众七千余户迁徙到北魏境内，并表奏朝廷设置城阳、刚陵、义阳三郡来安顿移民。孝文帝拓跋宏令韦珍移镇比阳，南齐萧赜得知消息后，派雍州刺史陈显达率部前来侵犯。比阳城中将士都要求出战，韦珍说：“敌军初到，士气锐利，不能立即挫败它，暂且共同坚守，等到他们攻城疲惫之后，再行出击也为不晚。”于是韦珍率众凭城拒战，杀伤大量南齐军。双方相持了十二天，韦珍趁夜打开城门偷袭南齐军，南齐军溃败，韦珍凭此战功晋爵位为侯。