病原为葱鳞葡萄孢菌（Botrytis aquamosa Walker），属半知菌亚门真菌。菌丝无色透明，有隔。分生孢子梗在寄主叶内伸出，在培养基上由菌核上长出，初淡灰色，后变暗褐色，具隔0-7个，基部稍膨大，顶部有较多的分枝，分枝处有时缢缩，顶端球状膨大，上密生小梗，孢子生在小梗顶端，孢子脱落后，侧枝干缩，形成波状皱折，后脱落，在主枝上留下清楚的疤痕，梗长（208-1216）微米×（9.6-19.2）微米。分生孢子卵形至椭圆形，透明，初浅灰，后渐变褐色，大小（12.5-25）微米×（8.75-18.5）微米。病菌生长发育适温15-21℃，空气相对湿度85%以上。温度20℃和空气相对湿度90%以上病害易流行。

韭菜灰霉病主要危害叶片。初在叶面上产生白色至浅褐色的小点，继而由叶尖向下发展。病斑扩大后呈椭圆形至梭形，后期病斑相连产生大片枯死斑，使半叶或全叶枯死。湿度大时枯叶表面密生灰色至灰褐色的绒毛状霉层。有时病叶上不产生白点，由割茬的刀口处向下腐烂，开始呈水渍状，后变为淡绿色，有褐色轮纹，病斑为半圆形或“V”；字形，湿度大则生灰褐色或灰绿色绒毛状霉层。引起整簇溃烂，严重时成片枯死。