预冻的目的也是为了固定物料，为接下来的升华过程准备样品。如果预冻温度不够低，物料没有冻实，在真空下残存的液体不仅会迅速蒸发，造成液体的浓缩使冻干产品的体积缩小，而且溶解在液体中的气体在真空下会迅速冒出来，造成像液体沸腾的样子，使冻干产品鼓泡，破坏产品的形状。如果预冻温度过低，则不仅浪费了能源和时间,而且对某些物料还会降低其存活率。因此,必须掌握合适的预冻温度。