1998年，则在当时刚落成的赤鱲角香港国际机场及青马大桥举行。共有约6000名参加者参加。

1999年，赛事首次移施至市区中心举行。于香港岛的中环金融中心作起点，并以九龙深水埗运动场为终点。共吸引逾7000名跑手参与 。

2000年，当年赛道的特色以著名的维多利亚港为起步点的背景。参赛者从尖沙咀香港文化中心出发，，并再以深水埗运动场为终点。赛事首次安排三项不同距离的赛事，包括马拉松、半马拉松及十公里赛。

2001年，参赛人数首次超过1万人。赛事在九龙尖沙咀弥敦道起步，经过西九龙公路、长青隧道，在青马大桥及汀九桥折返经西区海底隧道。终点则在湾仔金紫荆广场。

2005年，渣打集团并赞助首届“全球最强之战”，将渣打全球4个马拉松联为一个大型的马拉松比赛。

2006年，共有接近4万人参加。2月12日比赛当日，有2名参赛者晕倒，情况危殆，其中一人延至2月14日清晨3时许不治，另有4800多人抽筋，22人身体不适送院。马拉松比赛全程马拉松冠军由肯尼亚的博尔取得，时间是2小时14分18秒，女子组冠军则由埃塞俄比亚的图恩以2小时35分15秒获得，中国戴艳艳获得第4名，未能卫冕。

2007年，赛会汲取2006年的教训安排急救等，乃有破记录的6249人不适或受伤，占参加人数16.7%，35人需送院，其中一名年轻有经验男跑手疑因中暑情况危殆。

2008年马拉松的十公里项目与马拉松、半马拉松分开赛道，在东区走廊举行，终点设在维多利亚公园。而马拉松、半马拉松首次延伸至铜锣湾闹市，终点也改设在维园。不少参赛者认为，东区走廊的赛道较以往途经西隧好。而精英运动员都认为，改在维园冲线有助创佳绩。

2023年2月12日，第25届香港马拉松开跑。

2025年2月9日，2025香港马拉松举行。

1997年（渣打港深马拉松）

由香港上水起步，经过落马洲皇岗，并以深圳为终点。

1998年（渣打新机场马拉松）

由青马大桥起步，并以香港国际机场跑道作终点。

1999年

于中环作起点，途经西区海底隧道与长青隧道，并以九龙深水埗运动场为终点。

2000年

由尖沙咀香港文化中心出发，途经尖沙咀海滨花园、多个位于九龙的公共屋邨及横跨汀九桥，以深水埗运动场为终点。

2001年至2007年

赛事在九龙尖沙咀弥敦道近美丽华酒店起步，路线经过柯士甸道、广东道，然后上西九龙公路、长青隧道，在青马大桥及汀九桥折返经西区海底隧道、港岛林士街天桥、毕打街隧道、夏悫道天桥、添美道、分域码头街。终点则在湾仔金紫荆广场。

2008年

10公里赛事首次移师港岛区东区走廊举行。参赛者需由维园步行上东区走廊才能到达起点。起点香港东区走郎近兴发街维园出口-＞东区走廊西行线-＞筲箕湾折回点-＞东区走郎西行线-＞维园道西行线-＞告士打道天桥-＞维多利亚公园终点 半马拉松

起点：尖沙咀弥敦道介乎金巴利道及加连威老道-＞柯士甸道-＞广东道北行线-＞汇翔道西行线-＞连翔道北行线-＞过佐敦道后转入南行线-＞西九龙快速公路南行线-＞青葵公路南行线-＞荔景折回点-＞青葵公路南行线-＞西九龙快速公路南行线-＞西区海底隧道往香港岛方向-＞干诺道天桥东行-＞干诺道中东行线-＞毕打街隧道-＞夏悫道天桥-＞添美道-＞分域码头街-＞会议道-＞鸿兴道-＞马师道天桥-＞骆克道-＞东角道-＞记利佐治街-＞维多利亚公园终点

全程马拉松

起点尖沙咀弥敦道介乎金巴利道及加连威老道-＞柯士甸道-＞广东道北行线-＞汇翔道西行线-＞连翔道北行线-＞过佐敦道后转入南行线-＞西九龙快速公路南行线-＞青葵公路南行线-＞长青隧道南行线-＞青马大桥东行线-＞马湾折回点-＞青马大桥东行线-＞汀九桥南行线-＞汀九折回点-＞汀九桥南行线-＞长青隧道南行线-＞青葵公路南行线-＞西九龙快速公路南行线-＞西区海底隧道往香港岛方向-＞干诺道天桥东行-＞干诺道中东行线-＞毕打街隧道-＞夏悫道天桥-＞添美道-＞分域码头街-＞会议道-＞鸿兴道-＞马师道天桥-＞骆克道-＞东角道-＞记利佐治街-＞维多利亚公园终点

2009年

起点于尖沙咀，去青马大桥，经西区海底隧道，终点在维多利亚公园。

为庆祝香港主权回归中国，渣打银行于1997年首次赞助马拉松赛事，复办阔别了三年的“港深马拉松”。跑手从香港上水北区运动场出发，经过深圳皇岗口岸，横跨中国内地与香港两地边境，直至深圳体育馆冲线，有着香港顺利过渡的象征意义。这项赛事更是当时世界上唯一跑过两个地区的马拉松赛事。

1998渣打新机场马拉松在香港的全新标志-青马大桥起跑，沿着汲水门桥、北大屿山快速公路，一直跑到位于赤腊角的香港新机场，并在当时尚未启用的机场跑道上完成最后一段的路程，比赛过程峰回路转，精彩万分，令人叹为观止。1998渣打新机场马拉松吸引了超过6400名运动员参加比赛，缔造了当时香港长跑赛事的最高参赛人数纪录。

渣打银行于1999年再度开创先河，首次在中环闹市举行国际马拉松比赛。全长42.193公里的1999渣打马拉松由中环遮打道起跑，沿途经过西区隧道、三号干线、长青隧道、汀九桥，然后折回至深水埗运动场冲线。在中环建筑宏伟的商业大厦之环抱中跑步，有香港最繁华的景象为6900名运动员打气，令来自世界各地及本港的参加者更能享受比赛的过程，增加赛事的热闹气氛。

踏入2000年，渣打马拉松特别以尖沙咀海傍作起点，集合所有跑手在尖沙咀文化中心外一同起步，赛道围绕九龙区一些著名建设，运动员需由尖沙咀海傍，跨越汀九桥一直跑至深水埗运动场的终点。赛事更首次设有三个不同距离的项目：马拉松、半马拉松及十公里赛，挑战全港市民的耐力，令参赛人数再次突破纪录，高达7150人。

2001年标志着渣打银行成永晪U渣打马拉松的第五周年，参赛人数不断上升，首次突破一万大关，赛事共吸引超过10500名运动员参加马拉松、半马拉松及十公里赛三项不同距离的项目。

行政长官董建华先生在赛事当日上午七时正，于尖沙咀弥敦道的起点主持鸣枪，逾万名选手由尖沙咀出发，横跨西九龙公路，沿途经过青葵公路、长青隧道、青屿干线(包括青马大桥及汲水门大桥)，于汀九桥折回，穿过西区海底队道，直闯港岛中区各街道，最后于香港会议展览中心金紫荆广场冲线。吉尔吉斯坦女选手宝嘉高娃以2小时33分43秒的卓越成绩夺标，刷新香港被邀选手最佳时间。

渣打马拉松近年一直不断发展，在短短六年时间已成为香港最具代表性的长跑赛事，并且获得亚洲及国际体坛的认同，同场举行第八届亚洲马拉松锦标赛；逾50位来自27个亚洲国家及地区的优秀选手来港参加这项每两年一度的亚洲体坛盛事。

渣打银行为了提高赛事的吸引力，特别增设“达标奖励”计划。任何男子运动员能够在2小时11分内完成马拉松赛，便能获得一万美元的奖金；而女子运动员在2小时29分内完成赛事亦能获颁相同金额的奖金。是次赛事共吸引了13574位本地及海外运动员角逐马拉松、半马拉松及十公里赛三项赛事，结果肯雅选手马多罗和中国代表张淑晶在众多参赛者中脱颖而出，勇夺渣打马拉松的锦标。

2月17日，2019年渣打香港马拉松赛落幕，肯尼亚选手巴·基普图姆打破赛会纪录，夺得男子组冠军。

基普图姆跑出2小时9分21秒的成绩，打破埃塞俄比亚选手贝拉丘在2017年赛事中创造的2小时10分31秒的赛会纪录。埃塞俄比亚选手达·沃尔德以2小时11分11秒获得第二名，他的同胞特·塔德塞位列第三。

女子组方面，白俄罗斯选手沃·马祖罗纳克后程发力，以2小时26分13秒率先撞线，同时也刷新了赛会纪录。巴林选手尤·丘巴和埃塞俄比亚选手杰·舒尔分列第二、三位。

2021年10月24日，因新冠疫情一度停办的渣打香港马拉松赛恢复举行，香港选手黄启乐以2小时31分10秒的成绩夺得男子全程马拉松冠军，亚军和季军分别归属日本的城武雅及香港的魏赓；女子组方面，香港选手姚洁贞以2小时39分27秒赢得全程马拉松冠军，亚军和季军则分别由香港的黄卓宁和爱尔兰的凯特里奥娜·詹宁斯获得。

2022年9月16日，中国香港田径总会宣布，由于距离原定赛事日期只有两个多月，众多参赛选手和赛事相关方未必有充足时间做好准备，主办方决定取消计划于11月20日举行的赛事，2022年渣打香港马拉松取消。

2022年10月13日，香港马拉松主办方公布，第25届香港马拉松定于2023年2月12日举行，参赛名额暂定为25000个，将在11月上旬公布报名详情。

主办方表示，本届赛事划分为3个组别，包括马拉松、半马拉松和10公里，并将邀请海外精英跑手参加。赛事沿用传统路段，马拉松及半马拉松由尖沙咀弥敦道出发，10公里项目则以东区走廊作起点，所有组别均以维多利亚公园为终点。

在全程马拉松男子组的比赛中，来自肯尼亚的基普春巴以2小时10分47秒的成绩夺冠，另外两名来自埃塞俄比亚的选手分获二、三名。女子组方面，埃塞俄比亚选手包揽前三名。

2023年2月12日，第25届渣打香港马拉松，肯尼亚选手基普春巴获得全程马拉松男子组冠军，埃塞俄比亚选手金马获得全程马拉松女子组冠军。来自非洲的6名选手包揽了赛事全程马拉松男、女子组的前三名。

2023年8月30日，2024渣打香港马拉松启动仪式在中国香港举行，比赛将于2024年1月21日开跑，同场举办亚洲马拉松锦标赛。

2024年8月12日，香港马拉松官网公布，2025香港马拉松将于2025年2月9日举行，总参赛名额约7.4万个。本届赛事设有马拉松、半程马拉松、10公里赛及轮椅赛组别。其中全马和半马的起点设在尖沙咀弥敦道，10公里组别以东区走廊为起点；所有组别均以维多利亚公园作为终点。为了增加赛事的竞争性，年龄组别增至20个，男女各10个。