登位后面临的难题是恢复西方教会、重振教廷和再建教皇国。1418年康斯坦茨会议采纳他所提出的建议，规定凡属于教会的土地和城市一律由教会管辖，但他认为，要在这些地区树立自己的势力，强制不如通过外交。此次会议闭幕后不久，马丁谴责当时流行的谓教皇必须受会议节制的会议至上论；同时宣布，凡属教义问题，唯教皇有权裁断。意大利军人蒙托纳的布拉西奥野心勃勃，迫使马丁为难。原来马丁已于1420年任命他为教皇领地佩鲁贾和翁布里亚教区主教，但他得寸进尺，企图夺取意大利南部地区。1424年布拉西奥在阿奎拉一役战败。此后马丁在意大利甚为得手。由于马丁的活动，他所属的科隆纳家族在意大利南部领得大量封地，权势隆盛，在教皇领地内拥有广大庄园。马丁曾调解英法之间的百年战争，并曾着手组织十字军进攻波西米亚的胡斯派。马丁维护教会在英格兰和西班牙的权利，不容各国国王侵犯。