1995年，在NBA落选后，马健到菲律宾篮球联赛打了三个月的球，帮助所在球队拿到冠军，并当选为年度最佳外援。

1997年初，马健加盟北京首钢篮球俱乐部，当时的北京首钢队正在打保级战。2月16日，在北京首钢队以81-77战胜济部男篮的比赛中，马健出场36分钟，得到26分、8篮板和3助攻，完成个人CBA生涯首秀。2月19日，在北京首钢队以95-74战胜山东黄金队的比赛中，马健出场37分钟，得到31分、11篮板和2助攻，收获个人CBA生涯首个两双数据。3月12日，在北京首钢队以92-75战胜济部男篮的比赛中，马健出场40分钟，得到34分、7篮板和1助攻，刷新个人CBA生涯单场得分新高。

1996-97赛季，马健代表北京首钢队共出战4场常规赛比赛，场均38.3分钟，得到23.3分、7.3篮板和3.3助攻；代表北京首钢队共出战6场保级赛比赛，场均37.7分钟，得到22.5分、7.7篮板和1.8助攻，帮助北京首钢队保级成功。

1998年，马健加盟北京奥神职业篮球俱乐部，代表北京奥神队参加中国男篮甲B联赛，并帮助球队第一名身份晋升甲A联赛。

1998年12月27日，在北京奥神队以85-101负于山东黄金队的比赛中，马健出场48分钟，得到10分、6篮板和2助攻，完成个人在北京奥神队的CBA生涯首秀。

1999年1月6日，在北京奥神队以98-81战胜济部男篮的比赛中，马健出场44分钟，得到19分、10篮板和9助攻，刷新个人CBA生涯单场助攻新高。1月27日，在北京奥神队以103-72战胜江苏大华队的比赛中，马健出场38分钟，得到10分、10篮板、5助攻和5盖帽，刷新个人CBA生涯单场盖帽新高。3月28日，在北京奥神队以115-86战胜山东黄金队的比赛中，马健出场35分钟，得到18分、3篮板和2助攻，完成个人CBA生涯季后赛首秀。

1998-99赛季，马健代表北京奥神队共出战22场常规赛比赛，场均37.5分钟，得到14.3分、6.8篮板和3.9助攻；代表北京奥神队共出战5场季后赛比赛，场均35.0分钟，得到14.0分、2.4篮板和2.0助攻；最终帮助球队获得联赛第4名，并入选CBA全明星赛北方明星队。

2000年1月30日，在北京奥神队以109-86战胜辽宁盼盼队的比赛中，马健出场48分钟，得到16分、14篮板、9助攻和8抢断的准四双数据，刷新个人CBA生涯单场篮板和抢断新高。

1999-00赛季，马健代表北京奥神队共出战21场常规赛比赛，场均34.6分钟，得到14.2分、6.5篮板和2.9助攻；代表北京奥神队共出战2场季后赛比赛，场均41.5分钟，得到13.5分、10.0篮板和2.0助攻。

2000年12月3日，在北京奥神队以121-107战胜山东黄金队的比赛中，马健出场42分钟，得到27分、10篮板和3助攻，其中三分球13中7，刷新个人CBA生涯单场三分球命中数新高。12月21日，马健被北京奥神队辞掉，在该赛季剩余比赛中，马健再没出现在奥神队阵中。

2000-01赛季，马健代表北京奥神队共出战10场常规赛比赛，场均38.0分钟，得到15.8分、7.1篮板和3.5助攻。

2002年11月，马健签约上海东方篮球俱乐部。12月7日，在上海东方队以105-90战胜辽宁盼盼队的比赛中，马健出场24分钟，得到6分、2篮板和2助攻，完成个人上海队生涯首秀。

2003年3月，上海东方队裁掉马健。之后，马健选择退役。

2002-03赛季，马健代表上海东方队共出战19场常规赛比赛，场均18.1分钟，得到3.6分、2.9篮板和0.9助攻。

1989年，马健入选中国男篮，任主力前锋。

1990年，马健代表中国男篮参加篮球世锦赛，共出战8场比赛，场均得到12.4分。

1992年，马健代表中国男篮参加1992年巴塞罗那奥运会，共出战6场比赛，场均7.5分钟，得到3.7分、0.5篮板和0.3助攻。

参考资料：

退役之后的马健成为一名体育产业经营者，还拍过电影，还是一名篮球解说员。

2015-16赛季NBA总决赛开打前，马健预测了克利夫兰骑士队能获得NBA总冠军，最终骑士队在大比分1-3落后的情况下实现翻盘，在抢七大战中拿下队史首冠。

参考资料：

马健的技术特点是动作协调、反应灵敏、技术全面。（新浪体育评）

马健有典型的前锋身高，他的身体素质非常出色。马健的篮球生涯无疑是悲情的，他始终在和不接受他的社会和圈子作战，顽强地打拼出一个位置，努力去证明自己。他在献身的事业中屡次受挫，却不曾放弃。但是，在美国的经历是马健宝贵的财富，他终究为所爱的篮球拼搏过，无怨无悔。（腾讯体育评）

马健的球打得如何出色不敢恭维，但是，他的身上有种抹杀不掉的职业精神，这其实是没有在中国国外受过苦日子的中国球员最缺乏的。马健当年的自我放逐带有某种悲剧色彩，他是中国篮球界中对篮球最痴情的圣徒，单身闯荡江湖和王治郅及巴特尔等人不同，他始终在和不接受他的社会和圈子作战，顽强地打拼出一个位置，努力去证明自己。他在献身的事业中屡次受挫，却不曾放弃。他的经历很特殊，而这份特殊对他的回报却相当残酷。假如设立中国篮球的名人堂，马健肯定无缘进入，但是，中国篮球史上不应少了记录他这笔，不为别的，就为他那份痴情和经历。（南方网-南方都市报评）

2000年7月，上海东方职业篮球俱乐部和马健签订了聘用合同，当上海东方俱乐部将其作为2001赛季球员向国家篮球管理中心注册后，奥神俱乐部也将马健作为2001赛季球员注册，并提供了和马健签订的一份合同。马健认为自己根本没有与奥神俱乐部签过任何合同，更没有在合同上签过名，遂以奥神俱乐部侵犯了自己的姓名权为由，将奥神俱乐部告上法庭，要求对方赔偿经济损失30万元。

北京市朝阳区人民法院经审理后作出马健与奥神俱乐部和北京东景公司签订的、标明签订日期为2001年6月20日的《中国篮球协会俱乐部篮球队运动员服役合同书》无效；驳回马健的其它诉讼请求。

北京市二中院经审理后认为，虽然合同上签的名字确是马健所写，但当时上面并没有写关于马健的服役期限、合同生效日期以及马健的报酬，且没有盖任何章印，其合同是无效的。根据《劳动法》有关规定，劳动合同是否有效，劳动仲裁委员会或法院都可直接进行裁定。为此，终审判决，驳回北京奥神俱乐部和东景公司的上诉请求，维持原判。