马尔法·马特维耶夫娜·阿普拉克辛娜是马特维·瓦西里耶维奇·阿普拉克辛和多姆娜·波格丹诺夫娜·洛夫奇科娃的女儿。马尔法·马特维耶夫娜有三个兄弟，分别是彼得、费奥多尔和安德烈，他们都成为了彼得大帝统治时期的政治家和军事指挥官。

她与寡居的沙皇费奥多尔三世的婚姻是沙皇的朋友伊万·亚济科夫安排的，他希望借此巩固自己在宫廷中的地位。马尔法·马特维耶夫娜作为新娘得到了与阿普拉克辛家族关系密切的都主教希拉里翁的批准。1681年12月，她获得了皇室新娘的身份。1682年2月15日，17岁的马尔法·马特维耶夫娜与20岁的沙皇举行了婚礼。

马尔法·马特维耶夫娜从结婚到沙皇去世（1682年4月27日）只当了71天皇后。马尔法·马特维耶夫娜没有孩子，根据一些推测，她还是处女，她在悲痛中度过了三十多年。她先是住在莫斯科，然后住在圣彼得堡，她自己的宫殿就在金钟广场和涅夫斯基大街的拐角处，靠近她哥哥费奥多尔·马特维耶维奇·阿普拉克辛上将的宅邸。如今，冬宫就坐落于此。