更新时间：2023-05-29 11:30
2002年9月，北京航空航天大学高等工程学院成立。
2003年4月，召开首届导师聘任大会，启动实施本科生导师制；9月，高等工程学院党支部、学生会成立；10月，高等工程学院团支部成立。
2006年5月，高等工程学院、中法工程师学院联合直属党支部成立；9月，高等工程学院博士生班成立，探索博士拔尖人才培养模式。
2008年3月，改革招生模式，启动实施二次选拔；4月，搬迁至主楼南侧五层。
2009年10月，获批北京市级人才培养模式创新试验区。
2011年4月，获批进入教育部“基础学科拔尖学生培养试验计划”。
2012年9月，明确“书院制”育人体系。
2015年1月，北航中科院太空应用科教创新基地成立；5月，设立“北航高等工程学院钱士湘、杨宗智校友奖励基金”；9月，北航锐安联合互联网信息处理技术创新中心成立。
2016年11月，更名为“高等理工学院”，冠名“沈元荣誉学院”，明确承载拔尖计划、统筹理工试验班。
2020年9月，获批教育部“基础学科拔尖学生培养计划”2.0基地。
2021年6月，统筹拔尖计划和未来技术学院等国家级拔尖创新人才培养计划在北航的实施，建设“国家队”学院；7月，未来空天技术学院/高等理工学院成立，高等理工学院党委调整为未来空天技术学院/高等理工学院党委。
2022年4月，成为高校书院联盟成员单位；9月，国家卓越工程师学院设立，与高等理工学院和未来空天技术学院合署办公，校内统称沈元学院；10月，未来空天技术学院/高等理工学院党委调整为沈元学院党委。
学院承担基础学科拔尖学生培养计划、未来技术学院、工程硕博士培养改革专项试点等国家级创新人才培养改革任务。