鉴于秦、汉以来探讨天道之人或拘于数术，或沦于虚无，致使天下人郁闭不解的状况，鲍云龙作《天原发微》，主要是附会周易而研讨天人之关系，阐发天地人神之道理。他先列诸儒之说于前，而以己见辨论其后。依据《易大传》天数二十有五，而立书目二十五篇，博考详究，条分缕析。二十五篇主要内容如下：《太极》篇论述道体，认为太极是万物之本；《动静》篇论述道用，讲万物发展变化；《静动》篇论述用本于体，讲体用关系；《辨方》篇论述方位，认为一年四季运行必孕始于坎位；《元浑》篇讨论万物发展变化，认为万物始终表现为天道运行；《分二》篇讲动静初分，即天地氤氲；《衍五》篇讲阴阳再分，即两仪生四象；《观象》篇探讨四象各生两仪，即八卦；《太阳》、《太阴》、《少阳》、《少阴》四篇敷演邵雍之说，以日月星辰分别配四象；《天枢》篇讨论“大衍之数五十，其用四十有九”之故，以所余之一为北辰；《岁会》篇讲所谓“十二次”，即与“爻辰”说相关的太阳沿着黄道绕地球而所次的方位；《司气》篇讲七十二候，即易经与历法的关系；《卦气》篇讲挂气说，认为焦延寿、京房之学从《太玄》所出；《盈缩》篇讲推算设置闰年闰月之理；《象数》篇讲的是河图洛书为自然数的源头；《先后》篇论述先天八卦与后天八卦；《左右》篇讲左旋右旋之说；《二中》篇讲数字，认为五、六分别为天地之中；《阳复》篇讲复卦，认为“复”为天心；《数原》篇讲数字之变化，认为万变不出一理；《鬼神》篇论辨《易传》中所谓鬼神，认为后世理解之鬼神多非其正；《变化》篇说的是天之道与人之道的变化，认为天有天的变化，人有人的变化。全文以朱熹“主敬”之说作为结论。