2001年，担任中国作协第5届全委会委员，浙江省作协副主席、党组书记，省文联副主席；同年，成为中国作协第6届副主席；之后，由其创作的长篇小说《日出东方》获得国家图书奖、国家“五个一工程”奖；此外，还担任了电视剧《日出东方》的编剧，该剧记述了从1919年五四运动到1928年井冈山会师十年间发生的重大历史事件，形象地再现了中国共产党从诞生到发展壮大的曲折历程。

2003年，出版诗集《磕磕绊绊经纬线》。2004年，担任剧情电影《邓小平·1928》的编剧，该片讲述了1928年前后邓小平在担任中央秘书长期间的一段工作、生活经历，以及他的一段鲜为人知的爱情故事。2005年，出版诗集《父亲，父亲》；同年，担任警匪剧《步步紧逼》的编剧，该片以江西省安义县原县委书记买凶谋杀同事的案件为原型。

2006年，由其创作的诗集《行吟长征路》获得第4届鲁迅文学奖全国优秀诗歌奖。2007年，为纪念中国共产党80周年诞辰，担任了商战剧《淞沪风云》的编剧，该剧由孙淳、萧蔷 、佟凡联袂主演；同年，担任涉案题材电视剧《市委书记日记》的编剧，该剧是中国电视剧制作中心为迎接党的十七大召开而拍摄的作品。

2008年，创作诗集《中国如此震动》，该书是黄亚洲在“5.12”四川汶川大地震后汇集第一手资料而编写的诗集；同年，发表散文《外婆家的曙光》。2011年，担任人物传记剧《雷锋》的编剧，该剧还原了雷锋的一生，讲述了他从一名贫苦的农村孩子成长为一名共产主义先锋战士的生命历程。

2012年，创作长篇小说《雷锋》。2013年，与赵和、陆春祥等联合创作诗集《拱宸——运河南端话变迁》。2014年，担任编剧的传记剧《历史转折中的邓小平》首播，该剧由吴子牛执导；随后，出版抒情诗集《我在孔子故里歌唱》，该诗集共收录诗作45首；同年，担任剧情电影《毛泽东在上海1924》的编剧，该片由黄海冰、武文佳共同主演。

2015年，出版诗集《转身》；同年，创作诗集《舍她不得》。2016年，出版长篇小说《红船》，该小说记录了中国共产党诞生的历程。2019年，黄亚洲的长篇小说《日出东方》入选“新中国70年70部长篇小说典藏”。

2020年2月，出版“抗疫”个人诗集《今夜，让我的心跟随你们去武汉》。

2023年9月，被聘为长三角浙皖乡村乡贤联盟总顾问和安吉天子湖镇乡村振兴顾问。

作为一个作家与诗人，黄亚洲的作品显示出了强烈的智性特征。执守于崇高，根植于理性，他显示出了自己作品与众不同的魅力。在充满激情的抒写之中并不排斥理性的判断，理性在他的创作中反而变成了一种优势，一种人生经验的高度浓缩（《文艺争鸣》评）。

黄亚洲以他丰富的人生经验，充沛的情感，借助于视觉形象，试图打通万物与心灵之间的暗道。他以多产的影视作品享誉中国影坛，然而诗歌却是他独到的心灵栖息之乡。仿佛是影视作品的一种智慧的补充。他诗歌的语调有一种歌咏般的欢乐。这欢乐与他性格中的豪爽和幽默紧密关连。与英国诗人菲利普·拉金大量运用污言秽语不同，黄亚洲的诗歌整体上干干净净，有温柔敦厚的儒家之风。同时，他有一个较之一般人更加开放的胸怀，他的创作因此比一般人来得自由和宽敞，较少有局促之感（《南方文坛》评）。

黄亚洲长期在工农兵之中生活和观察，思考着中国的命运、单位的命运和他人的命运，他在阅读所有叙述历史的书籍的时候，都带着自身的政治经验和生活经验。他以他剧作家的优势，加上诗人的想像力，紧紧抓住特定历史事件中特定的人物，特别是对毛泽东、陈独秀等领袖人物的刻画，做到了活灵活现栩栩如生。作为一个浙江的本土作家，黄亚洲很关心浙江的文化建设，在接受省内外各媒体的采访中，他始终把建文化大省放在心上说在嘴里。他以写诗进人文坛，又以剧作而闻名全 国，创作的欲望和实践是他生命的一大部分（《今日浙江》评）。