1911年8月，武昌起义成功，章太炎归国，得到袁世凯支持，发起成立“中华民国联合会”，嘱黄墨涵去上海起草章程，后改为“统一党”；1912年5月，再与“民主研究会”及“协进会”合并为“共和党”，黄墨涵任总务主任；创办《大共和日报》，黄墨涵任主笔，作社论、时评，反对建都南京，与国民党上海各报成对立形势。7月，黄墨涵当选四川临时参议会代表，在会上又被选为审查长。8月18日新共和党四川支部成立，黄墨涵任常务千事，并负贵筹建重庆支部。1912年3月，黄墨涵被选为中华民国众议院议员；7月19日复被选为宪法起草委员，在天坛起草《宪法》。1915年，袁世凯等筹备帝制，黄墨涵等开会反对，被捕，关华阳县署，后转法院看守所。1916年，云南护国军入川，袁世凯死。8月，国会恢复，黄墨涵去北京继议《宪法》，先后参加反张勋复辟和反曹锟贿选。1924年，黄墨涵为四川财政厅长。