2023年，入选2023年国家击剑队第一期集训名单。1月，参加国际剑联花剑世界杯巴黎站比赛中，黄芊芊所在的中国队获得女子团体第5名。3月，2022/2023赛季世界杯系列赛—女子花剑世界杯第三站，黄芊芊所在的中国花剑队获得团体赛第六名；个人赛中黄芊芊获第28名。4月13日，2023年全国击剑冠军赛分站赛（第一站），黄芊芊在成年女子花剑个人四分之一决赛中不敌林绮雯，最终获得第七名。4月16日，2023年全国击剑冠军赛展开成年女花团体赛，黄芊芊所在的队斩获成年女花团体第一名。6月7日，2022/2023赛季世界杯系列赛第比利斯女子花剑世界杯，黄芊芊收获团体赛第7名。2023年6月18日，2023年亚洲击剑锦标赛女花方面，黄芊芊不敌队友陈情缘无缘四强。6月21日，黄芊芊所在的中国女子花剑队摘得女子花剑团体赛银牌。7月，入选2023年米兰击剑世锦赛中国队参赛名单。7月，参加第31届世界大学生夏季运动会击剑-女子花剑个人项目。8月6日女子花剑团体金牌赛，所在的中国队获得金牌。8月，入选杭州亚运会击剑项目女子花剑团体赛及个人赛名单。9月1日，2023年全国击剑冠军赛（总决赛）女子决赛，黄芊芊获得亚军。9月3日，在2023年全国击剑冠军赛总决赛中，所在的福建队夺得女子花剑团体冠军。 9月4日黄芊芊获得成年女子花剑个人亚军，黄芊芊所在的福建队获得成年女子花剑团体冠军。2023年9月25日，在杭州第19届亚运会击剑 - 女子个人花剑比赛中获得冠军。9月28日女子团体花剑决赛中，黄芊芊所在的中国队以34-31战胜韩国队，获得冠军。10月19日，2023年全国击剑锦标赛女子花剑个人赛中，黄芊芊战胜吴培林获得冠军。10月21日，在2023年全国击剑锦标赛成年组女子花剑团体比赛中，陈情缘、傅依婷、黄芊芊、郑璐璐组成的福建省击剑队获得冠军。