史 赤松贞范（则村的二男）在建武二年（1335）时，于丹波国水上郡的山顶上构筑黑井城，之后由荻野伊予守秋清担任城主。天文二十三年（1554）当秋清被一族荻野直正击倒后，由荻野直正入黑井城。直正并率领赤井一族在永禄八年（1565）击败丹波守护代内藤宗胜，同时制压天田郡及何鹿郡，将势力扩展至丹后及但马一带，今曰所见的黑井城遗构大半都是在这个时期所改修构筑的。天正初年以后城主荻野直正以黑井城为根据地，开始反抗织田信长，成为反织田势力的一翼，并与武田胜赖、石山本愿寺和毛利氏（吉川元春）互通声息。天正六年（1578）当直正病死后，子直义和直正之弟幸家联手指挥一族。天正七年（1579）八月九曰在光秀的攻打下黑井城落城，