琉璃的拿手战术是XYZ召唤5素材的【叙情歌鸲-群聚夜莺】向对方直接攻击，用代破效果撑到下回合再次发起攻击。因为被融合次元“学园”洗脑的缘故，所以琉璃也习得融合召唤。而且她的卡组也被加入了一些【寄生融合虫】相关卡。【叙情歌鸲-群聚夜莺】与【叙情歌鸲-独立夜莺】象征着琉璃性格中的两面性，一方面作为团结弱小群聚而生的【抵抗运动】成员，另一方面内心又渴望脱离哥哥的影响能做到自我独立。

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在XYZ次元“心园”还未遭受融合次元的侵略的时候，学园派来的间谍丹尼斯·麦克菲德为了寻找琉璃来到了心园，在街头卖艺期间在围观的观众中发现的她，随后与其相识。发现琉璃后，丹尼斯不得不结束娱乐时间，发出了“狩猎游戏”的指示，学园的军队开始了对心园的侵略。学园士兵们操纵着大量巨型决斗怪兽“古代的机械混沌巨人”摧毁心园的建筑，到处引发火灾，路边的琉璃抱着一个小女孩，对着旁边的好友笹山沙耶加哭泣着说道“决斗不是斗争的工具，决斗是为大家、为孩子们的未来带来笑容的东西”，在一旁的游斗对这番话若有所思，记了在心头。

作为“抵抗运动”一员的琉璃，跟其他女性一样负责挑水、做饭、分饭等家务活。某夜，琉璃像往常一样挑水时遇到了丹尼斯，不久就遭到学园派来的游里追赶并被逼到死胡同，琉璃举起了决斗盘反抗游里，可惜不敌游里。此时琉璃的好友沙耶加刚好躲在附近，她因胆怯而未能出手相救，眼睁睁地看着朋友被游里抓走，对此一直感到内疚。

得知妹妹被学园捉走的黑咲隼，为了用学园首领的儿子赤马零儿跟赤马零王换回琉璃而前往基础次元“舞网市”，游斗也紧随隼而去。二人一度把和琉璃一样长相的柊柚子当作琉璃，此时柚子正刻苦学习着融合召唤，二人才确定对方不是琉璃，游斗说琉璃是不可能主动地去学习敌人的召唤术。

为了感谢黑咲隼，天城快斗前往融合次元去营救琉璃，并从丹尼斯口中得知琉璃被关在了学园岛的西塔。快斗击败了西塔的守卫狄安娜，撞开了囚禁着琉璃的房间。快斗看到了安然无恙的琉璃，对她说：“走吧，隼在等着你”，琉璃感动地说道：“谢谢你。”然而琉璃的脑部已被学园的博士植入了洗脑用的寄生虫。在囚房外的东塔顶层，琉璃把快斗从塔顶推了下去。及时赶来的黑咲隼救下了快斗，快斗告诉隼是琉璃把他从塔顶推下去的，遗憾地说道：“你的妹妹变了。”震惊的隼马上爬楼梯上塔顶去见琉璃。和隼同行的爱德·菲尼克斯告诉快斗，琉璃可能是被学园的人操控着。

久别重逢的黑咲兄妹相互拥抱，快斗称琉璃被学园的人操控着，隼不信。然后琉璃情况骤变对隼挑起了决斗。隼只能相信了快斗的话，为了以自己力量救出妹妹而单独对抗。二人展开决斗之后，隼讥讽妹妹“离开我什么也做不到”，琉璃召唤出XYZ怪兽“叙情歌鸲-群聚夜莺”向隼发起多次连直接攻击，隼称进攻太弱，都不屑于捡动作卡对抗。这时琉璃召唤出隼未见过的怪兽——寄生融合虫，并使出融合召唤，召唤出融合怪兽“叙情歌鸲-独行夜莺”。并不慌张的隼用陷阱卡避过怪兽攻击，又捡取动作卡的削血效果。隼也召唤出乎琉璃意料的怪兽——小妖精，并XYZ召唤出“急袭猛禽-异邦猎鹰”。琉璃本来欲使用“寄生融合虫”的效果来代替破坏，但是内心深处琉璃自己的意识恰巧苏醒，及时阻止了效果的适用。醒过来的琉璃要哥哥赶紧攻击，因此落败并倒地昏迷。

隼背着琉璃走下百层楼塔，然后因体力不支而昏倒。清醒过来的琉璃赶忙去找回快斗，遇上了在学园内寻找柚子下落的游矢。此时，学园的博士再次启动寄生融合虫的力量将琉璃洗脑，琉璃向游矢挑起了决斗。使出融合召唤的琉璃的攻击毫无卵用，这时同样被洗脑的塞瑞娜乱入决斗支援琉璃。琉璃和塞瑞娜使用以寄生女王、寄生融合虫为主的寄生卡组向游失进行激烈的攻防。最后游矢和游斗使用霸王烈龙异色眼烈火龙一举将二人打败。落败的琉璃和塞瑞娜引诱游矢掉进铁牢陷阱。

零王把博士杀死后，4名少女的洗脑被解除。零王把她们关在管子里，正准备把她们合一来复活女儿蕾（Ray）。

最终与柊柚子、凛、塞蕾娜合为一体重生，存活在柚子的体内。