1937年7月7日，中日全面战争爆发。日本关东军参谋总部数次机密外泄，引起了土肥原贤二的高度重视，他查出所有的事情都与一个代号叫“野狼”的人有关，他让山口一男全力搜捕打入日军内部的国民党间谍和“野狼”。而此时，戴笠发现已经有日本特工盯上廖思成，他决定将计就计，命廖思成到南京查明当年失踪宝藏的下落并执行16号密令，并命方天翼配合廖思成的行动，并伺机查明廖思成的真实身份。在南京，方天翼和廖思成经过努力，终于获得16号密令的图纸。在得知16号密令的内容后，销毁了图纸。在俞梅、顾婷和廖思成日本恋人大岛由美的配合下，方天翼获取情报，阻碍了日军继续进军的步伐，并成功在南京城制造了混乱，并将反应日军暴行的两卷珍贵胶卷在国际上公布。在此期间，方天翼发现了廖思成、俞梅和大岛由美的中共地下党身份，但注重兄弟情义的他并没有将此事上报给戴笠，而且，看到戴笠为了打击日军想牺牲南京几十万百姓生命和共产党对个人的尊重，方天翼的思想发生了转变。而此时，松下健发现了方天翼“黑狐”的真实身份，双方较量中，廖思成、俞梅先后牺牲，方天翼也在两人感召下，和顾婷加入新四军。加入新四军后的方天翼继续跟坂田之助为首的日军展开较量，他组建“黑狐突击队”，充分展示他军事上的天分，夜袭句容县城、炸毁虹桥机场，令日军闻风丧胆，方天翼也最终干掉坂田之助。“皖南事变”后，新四军重建军部。方天翼也踏上了新的征途。