2004年4月，黑龙江省森林工业管理干部学院与黑龙江省林业教师进修学院合并组成黑龙江生态工程职业学院。

2009年，学院通过教育部人才培养工作评估。

2011年，学院被黑龙江省教育厅正式批准为省骨干高等职业院校建设项目立项单位。

2021年9月30日，通过教育部职业教育与成人教育司组织的现代学徒制第三批试点验收。

据2024年5月学校官网显示，学校下设7个教学院系，开设了40多个专科专业。

据2024年5月学校官网显示，学校有专任教师253人，其中副高级以上职务教师105名，具有高级职务教师占专任教师的比例为41.50% ；具有硕士研究生以上学位教师占专任教师的比例为63.24% ；双师素质教师202人，“双师型”教师占专任教师比例达到79.84% ；有来自企业的兼职教师186人；学校有全国优秀教师、全国优秀思想政治理论课教师、省（部）级教学名师、省级教学新秀、省级教学能手、知名专家学者30多人；有园林技术、建筑室内设计专业省级教学团队2个。

据2024年5月学校官网显示，学校有教育部现代学徒制试点专业3个，教育部“1+X”证书制度试点专业2个，教育部高等职业教育创新发展行动计划骨干专业2个，黑龙江省高水平骨干专业2个，中央财政支持重点建设专业2个，国家林业和草原局高职院校重点建设专业1个，黑龙江省高职院校重点建设专业8个，黑龙江省卓越农业人才培养项目重点建设专业2个，黑龙江省骨干校重点建设专业4个，黑龙江省首批现代学徒制试点专业3个，有校内外实习实训基地310余个。

截至2018年12月，学院设有紫丁香智能装备研究院，联合企业成立黑龙江省中林生态环境保护科学技术研究院。

2013-2014年，学校教师在学术刊物上发表研究论文160余篇，省（部）级科研成果奖20多项，获得专利6项。

2020年，学院15项申请获批立项为黑龙江省教育科学“十三五”规划2020年度重点课题。

截至2018年12月，黑龙江生态工程职业学院图书馆藏书38.59万册。

《林区教学》设有栏目：数理园地，体·音·美，外语教学研究，语文园地，政·史·地，职业教育研究。《林区教学》为中国学术期刊（光盘版）全文收录期刊，《中国核心期刊（遴选）数据库》收录期刊，中国人民大学书报资料中心《复印报刊资料》来源期刊，维普期刊网全文收录期刊。

《黑龙江生态工程职业学院学报》设有环境保护、城市建设、林业技术、农业研究、旅游研究、应用技术、实践探索、政法研究等栏目，是中国学术期刊综合评价数据库来源期刊，被《中国期刊网》《中国学术期刊（光盘版）》、维普《中文科技期刊数据库》、万方数据全文收录。

截至2018年12月，学院先后与中国龙江森林工业集团有限公司、华为、中兴、北汽集团、紫丁香管理咨询股份有限公司、北京沐维公司、华育中航（北京）公司、中铁十四局、中铁隧道、哈尔滨盛世特种飞行器有限公司、北京天竺乡村运动俱乐部等20多家企业合作开展订单培养，与哈工大创业校友联合会（紫丁香管理咨询股份有限公司）共建混合所有制的“工大智能装备学院”二级学院。

校徽呈圆形，绿色喻示生命、生机；双手托起的地球喻示保护地球就是保护我们的家园，体现了生态工程职业学院办学方向和内在追求。

学校校旗为长方形旗帜，中间印有规定字体的“黑龙江生态工程职业学院”校名（另附图案），由体现自然生态的蓝、白、绿三色组成，表达学院崇尚明丽清澈的蓝天、清新纯净的空气、生机盎然的绿色大地，致力于生态建设人才培养的坚定信念。

道德为重，技能为本

《生态之歌》。

9月20日。