龙岩检验检疫局于1999年11月23日正式挂牌，内设办公室、综合业务科、检验监管科、检疫查验科三科一室，共有行政编制22名，事业编制4名，现有干部职工23人，其中大专以上学历21人，占全局总人数的91.3%，党员18人，占全局总人数的78%。拥有固定资产867万元，占地23亩，投资规模1500万元，建筑面积5849平方米的综合实验楼于2005年11月18日投入使用。现有化矿实验室1个，HIV初筛实验室1个，肺结核实验室1个和临床实验室1个。

2018年5月28日，入选中共福建省委文明办“第十三届福建省文明单位”候选名单，并向社会公示，接受群众监督。