上海交通大学从1931年起培养研究生，是中国最早招收研究生的大学之一。经国家批准，上海交通大学于1984年4月试办研究生院，并于1996年2月首批被批准正式成立研究生院。

同时，上海交通大学积极推进研究生教育国际化进程。经中国教育部（原中国国家教委）批准，1993年上海交通大学率先在新加坡设立了海外教学点，开展海外研究生教育。成为中国教育界拓展海外教育市场的一次新的尝试。经中国教育部批准，2001年11月上海交通大学与新加坡南洋理工大学签署了办学协议，上海交通大学将原有的新加坡教学点移至南洋理工大学。并于2002年10月在南洋理工大学成立了“上海交通大学新加坡研究生院”，是中国第一所也是唯一在海外设立研究生院的大学。在新加坡经济发展局的推动下，上海交通大学成为新加坡政府引进十所世界级顶尖大学中的第九所大学，为海外高层次办学积累了一定经验。通过十几年的海外办学经验，不仅扩大了中国高等教育的国际影响，树立了上海交通大学新加坡研究生院海外办学的良好形象，同时也提高了上海交通大学在海外的知名度，为新加坡与中国的经济贸易往来和新加坡、中国的经济发展培养了一批高层次、应用型专业人才。面对新世纪科学技术的迅猛发展和知识经济时代所带来的机遇和挑战，上海交通大学新加坡研究生院教育将继续以培养具有突出创造能力和进行国际学术对话的专门精英人才为工作目标，努力加强学科建设，优化结构，深化教育改革，提高培养质量，树立上海交大新加坡研究生教育培养的品牌。