伍特公为主任，张瑛亭、马人斌、杨稼山、马超群为副主任。下设总务、教务、财务、殡葬等组。主要工作是：调整充实清真寺的领导，将原有19所清真寺(含女学1所)，根据财力和穆斯林分布情况，调整为9所清真寺(含女学1所)，同时，建立各清真寺管理委员会。统一管理清真公墓，将原由上海回教堂理事会和各清真寺分散管理的清真公墓，集中统一管理。将原上海回教堂理事会管理的房地产，以及草鞋湾、斜桥等伊斯兰教的房地产，统一管理，建立健全房地产管理制度。接收上海穆民经书社和中国回教经书局。创办上海少数民族金属工具厂(1977年改名民族拉丝模具厂)及真如家禽兽饲养场(后与嘉定外岗农场合并)。统筹各清真寺的经费开支，包括教职人员的工资福利待遇等。

1962年8月，上海市伊斯兰教协会成立，清管会工作宣告结束。