1965年4月，东沟镇从东沟公社析出，为县属镇。

1969年冬，东沟镇并入东沟公社。

1983年9月，东沟公社改为东沟乡。

1984年3月，由东沟乡改为东沟镇。

2001年7月，永兴镇并入东沟镇。

2009年11月，公兴、硕集2镇并入东沟镇。

截至2011年末，东沟镇辖永兴、市民、新东、西城、海北、硕集、公兴7个社区和黎明、东南、沿河、北堆、嵩乳、阜益、东方、丁横、镇南、永西、五楼、官庄、合心、兴园、阳光、阳河、双桥、计桥、张单、东崔、何桥、北盛、三益、青墩、孙利、青南、东盛、双河、桥东、太平桥、裴桥、射河、崔庄33个行政村；下设32个居民小组、260个村民小组。

截至2020年6月，东沟镇辖7个社区、33个行政村：市民社区、新东社区、西城社区、海北社区、永兴社区、硕集社区、公兴社区、黎明村、东南村、沿河村、北堆村、嵩乳村、阜益村、东方村、丁横村、镇南村、永西村、五楼村、官庄村、合心村、兴园村、阳光村、阳河村、双桥村、计桥村、张单村、东崔村、何桥村、崔庄村、射河村、裴桥村、太平桥村、桥东村、双河村、东盛村、青南村、孙利村、青墩村、三益村、北盛村，镇人民政府驻市民社区。

东沟镇地处阜宁县西南部，东、南分别与建湖县高作镇、建阳镇交界，西与益林镇、板湖镇毗邻，北与新沟镇接壤，距阜宁县人民政府24千米，区域总面积169.68平方千米。

东沟镇地处里下河低平原，地势平坦；北部略高，南部稍低。

东沟镇气候温和，雨量充沛，四季分明，年平均气温16℃，平均无霜期213天，年平均降雨量890毫米。

东沟镇主属射阳河水系；境内河网稠密，主要河流有射阳河、恒河、海陵河、嘎粮河、薛梨大沟、民便河等。

东沟镇土壤为沙性土质，pH值为6—8。

东沟镇主要自然灾害有台风、洪涝和冰雹等；台风、洪涝多发生在夏季。

东沟镇境内野生动物资源有野兔、草狐、等；野生植物资源有马兰、牛蕾子等。2011年，东沟镇有耕地14.7万亩，人均1.3亩。

截至2011年末，东沟镇总人口有115718人，其中城镇人口40313人，城镇化率34.8%；总人口中，男性60755人，占52.5%；女性54963人，占47.5%；以汉族为主，占99.8%。2011年，东沟镇人口出生率13.01‰，人口死亡率10.88‰，人口自然增长率2.13‰，人口密度为每平方千米682人。

截至2017年末，东沟镇常住人口为84616人。

截至2018年末，东沟镇户籍人口为114523人。

截至2019年末，东沟镇户籍人口为113898人。

2011年，东沟镇实现生产总值25.4亿元，其中第一产业增加值5.3亿元，第二产业增加值13.1亿元，第三产业增加值7亿元，第一、二、三产业增加值比例为20.9:51.3:27.8。2011年，东沟镇财政总收入2.2亿元；人均财政收入1901元。2011年，东沟镇农民人均纯收入10367元。

截至2018年末，东沟镇有工业企业341个，其中规模以上22个，有营业面积超过50平方米以上的综合商店或超市377个。

截至2019年末，东沟镇有工业企业336个，其中规模以上23个，有营业面积超过50平方米以上的综合商店或超市378个。

2011年，东沟镇农业总产值10.4亿元。东沟镇粮食作物以稻谷、小麦为主。2011年，东沟镇生产粮食11万吨，人均951千克。东沟镇主要经济作物有花生、油菜籽、棉花、蔬菜瓜类等；畜牧业以饲养生态猪、禽类为主。2011年，东沟镇生产肉类2.6万吨；畜牧业总产值3.7亿元，占农业总产值的36%。2011年，东沟镇水果种植面积1400亩，产量4500吨，主要品种有梨、桃等；渔业以淡水捕捞、淡水养殖为主；渔业总产值1.3亿元，占农业总产值的13%。

2011年，东沟镇工业总产值为70.6亿元，有规模以上工业企业16家，职工1909人，实现工业增加值8.5亿元。

2011年末，东沟镇有3家银行开设有分行；各类存款余额为10亿元；人均储蓄8642元；各项贷款余额1.1亿元。

2011年，东沟镇邮政业务收入为598万元；电信业务收入为3993.9万元。

截至2011年末，东沟镇有幼儿园15所；小学3所，小学适龄儿童入学率100%；初中3所；初中适龄人口入学率、小升初升学率、九年义务教育覆盖率均达100%；普通高中1所。2011年，东沟镇教育经费0.67亿元，国家财政性教育经费0.52亿元。

截至2011年末，东沟镇有文化艺术团体1个；电影放映单位1个；有文化站1个，藏书量1万册。

截至2011年末，东沟镇有各级各类医疗卫生机构40个，其中卫生院3所；设病床152张，每千人拥有医疗床位1.3张；专业卫生人员97人，平均每千人拥有卫生技术人员0.8人。2011年，东沟镇法定报告传染病发病率为55.9/10万，农村安全饮用水普及率100%，新型农村合作医疗参合人数7.3万人，参合率100%；孕产妇死亡率为0。

2011年，东沟镇农村最低生活保障户数2842户，人数3428人，支出440.6万元，月人均107.1元；农村五保集中供养55人，支出20.9万元；农村五保分散供养597人，支出191万元；农村医疗救助43人次，民政部门资助参加合作医疗6127人次；农村临时救济213人次，支出8万元；参加新型农村社会养老保险25128人，参保率79%。

截至2011年末，东沟镇有邮政网点3个，投递路线单程长度29.8千米，投递点3个，乡村通邮率100%；全年征订报纸125.9万份、期刊4.2万册；有电信服务网点4个；固定电话用户2.6万户，移动电话用户6.4万户。

截至2011年末，东沟镇有35千伏及以上变电所3座，有主变压器6台。2011年，东沟镇售电量累计完成2.5亿千瓦时，综合电压合格率、供电可靠率均为100%。

截至2011年末，东沟镇有县乡级公路5条，总长23千米；开通公交汽车线路2条。东沟镇有省道348（阜杨线），阜兴泰高速公路贯穿境内并设有东沟高速出入口。

东沟镇因南宋时该地一河称轧东沟，一称闸东沟，即今海陵河，后简称东沟；镇以河名。

2022年1月29日，被江苏省爱国卫生运动委员会纳入2021年江苏省卫生镇命名名单。