西车辆基地设于西28丁目站和二十四轩站之间，是东西线的首个车辆基地。亦是札幌市营地铁的首个全地下车辆基地。基地的设施全部建设在地下，地面是住宅区和停车场。西车辆基地初期负责东西线所有车辆的检修和停放，其后东车辆基地完工，检修和夜间停放均移至东车辆基地进行，因此西车辆基地曾空置了一段时间。东丰线落成后，由于未能寻找到地块建设车辆基地，札幌市交通局最后决定活用西车辆基地，让其成为东丰线的车辆基地。而为了让东丰线列车能驶进西车辆基地，札幌市交通局建设了连接东西线西11丁目站和东丰线札幌站的联络线。

东车辆基地位于云雀丘站西南偏西的位置，但车辆基地不是以直线和云雀丘站连接，而是迂回地以桥梁横渡附近的三里川两次（桥梁结构和南北线的高架路段相同），连接云雀丘站侧面的出入库调车专用月台，再从这里和往新札幌站的本线汇合。过去东车辆基地曾负责车籍在西车辆基地的东丰线列车的大规模检修，并负责东西线全线列车的检修和夜间停放。现在只负责东西线全线列车的检修和夜间停放。而列车出车入库均为无人驾驶，依靠列车的自动列车运行装置控制，并通过车辆基地的调度控制中心管理。8000型列车自动回库时，车头的电子方向幕会显示“自动回送”字样，6000型则会亮起自动回送的指示灯。

除了首班列车由南乡7丁目车站开出外，东西线列车均由宫之泽车站开出，以各站停车方式行驶。

班次方面，早上繁忙时间每4分钟一班，傍晚繁忙时间每5－6分钟一班，非繁忙时间每6－7分钟一班。

为了避免乘客跳轨自杀，及避免乘客误触未停定的列车和失足掉到轨道上受伤，札幌市交通局决定引入在东京、大阪、横滨、福冈等地铁采用的月台幕门（札幌市交通局称为“可动式月台围栏”）。其中东西线的南乡7丁目车站被选为先行安装和进行试验的车站，于2008年2月安装，5月试验完成后正式启用。东西线其余车站也跟着于同年9月起自新札幌车站开始逐一安装月台幕门和启用，至今（2009年2月12日）已完成新札幌车站－二十四轩车站的安装工程，并预定于2009年3月3日完成宫之泽车站的安装工程。

随着全线月台幕门安装完成，东西线将会于2009年4月1日开始改为单驾驶运作（ワンマン运転）。安装月台幕门除了防止意外发生外，更能节省操作列车和管理车站的人手，减省开支。另外，由于月台幕门只以7辆编组列车的设计安装，因此虽然东西线各站月台均能容纳更长的列车（新札幌车站－琴似车站：最长9辆编组，发寒南车站－宫之泽车站：最长8辆编组），短期内东西线受月台幕门的限制，将不会延长列车编组。

月台幕门关闭时，幕门上的警告灯会点亮，同时也有告警音提示乘客。

根据札幌市交通局进行的调查，2006年度每日平均有207,035人（换乘的乘客除外）使用东西线，比上一年度上升0.4%。连换乘的乘客则有267,168人。

所有车站都位于北海道札幌市内。