佛山市疾病预防控制中心下设办公室、疾病预防控制科、计划免疫科、艾滋病防制科、公共卫生科、消毒杀虫科、健康检查科、卫生检验科等八个职能科室。负责全市急性传染病、慢性非传染性疾病的流行病学监测和预防控制及免疫预防接种和预防用生物制品管理；实施艾滋病预防控制计划；承担对本地区寄生虫病、地方病防治，病媒生物的种群分布、生态习性和季节性消长情况，做好预测预报工作，负责消毒杀虫及相关的技术服务；承担佛山市健康相关产品卫生、环境卫生、学校卫生监测、检验和市卫生监督所委托的检验工作；负责食品生产企业和饮食服务从业人员的健康检查。业务范围包括佛山市管辖的禅城区、南海区、顺德区、三水区、高明区。本中心是中山大学医学部、广东药科大学等医学院校教学和实习基地。现有在职干部职工53人，其中硕士学历5人，本科学历24人，大专学历9人，中专及以下学历15人；高级职称14人，中级职称15人，初级及以下职称24人。检验中心设有百级实验室、艾滋病确认实验室，以及理化检验、微生物检验、临床检验等功能实验室。拥有气—质联用仪、定量PCR检测仪、原子荧光光度计、离子色谱仪、倒置荧光数码显微镜、全自动生化分析仪、全自动细菌鉴定仪、全自动荧光免疫分析仪、原子吸收分光光度计、气相色谱仪、高效液相色谱仪、紫外分光光度计、全自动加样器、微波消解仪等较为先进的仪器设备。