“正心以为本，修身以为基”，培养“明德、知礼、向善”的人格，是五中分校德育工作的目标。为此，学校形成了“养成教育”的传统特色。见微知著，积小成大，学校把养成教育化解到一日生活规范中，“进校、晨检、卫生、考勤、上课、课间、出操、午休、礼仪、纪律、公物”等十一个方面的要求，使学校生活井然有序。从他律到自律，学生便拥有了一把重塑自己，改变命运的金钥匙。

良好的道德修养和性格品质不仅需要日常生活中的积累，更需要教育者有意识的教育设计。学校充分利用现代信息技术，构建数字德育平台，校园网、班级网、个人网页成为师生们喜闻乐见的展示个性、体现民主和弘扬校园文化的舞台。学校依托丰厚的教育资源，创设了以“感悟古都、融入自然、走进名校、迈进社区、奉献爱心”为主题的系列学生活动体系和综合实践课程体系，这些活动和课程层次分明、充满乐趣。“走近名人”系列主题教育活动，使学生们在与名人的零距离接触中，感受他们丰富的阅历和高尚的人格，在耳濡目染中树立远大的理想和追求成功的信心和勇气。初一年级的定向越野，既有能力的拓展，也有意志的磨练。看地图、测等高线、识别植物、锻炼体能等多项知识技能在实践中得到应用；初二年级的“延安之旅”，既有革命情感的体验，也有对人生理想的思索。杨家岭、枣园里的学习参观，宝塔山下的入团仪式，壶口瀑布前的激情歌唱，黄帝陵轩辕庙里、秦始皇兵马俑前的文化品味，让学生在“潜移默化”中受到熏陶。初三年级的“拓展训练”，既有战胜自我的快乐，也有竞争与合作的趣味。学生们在体验中挖掘潜能、获得感悟、增强自信，超越自我。提供满足学生需要的教育，促进学生自觉进行人生规划，让学生健康快乐成长，始终是五中分校的追求。

好的教育带给学生的是身心的全面发展。学校把学生的身心健康放在首要的地位，给他们充裕的锻炼时间，活动空间也从操场延伸到了体育场、公园、甚至郊外……“3+1”篮球、跳绳、乒乓球等各种有趣的体育运动为学生们所钟爱。作为“北京市百所课间操先进校”、“北京市落实体育工作条例达标校”，连续十年中考体育加试成绩全区第一。学校乒乓球队、篮球队也屡创佳绩，在北京市体育传统项目学校青少年兵乓球比赛中连续多次取得团体第一名；在2009年北京市中小学生篮球联赛中荣获初中男子组第一名。良好的体育文化已成为五中分校的一个品牌。

作为北京市中小学艺术特色校，学校十分重视面向全体学生的艺术教育。全校十分之一学生参加的五中分校民乐团、合唱团已具有相当高的艺术水准，多次在北京市中小学生艺术节获得一等奖，2010年2月，学校金帆民乐团又夺得全国第三届中小学生艺术展演一等奖。除了参加国家级、市级比赛以外，还经常登上大雅之堂，好评如潮。王府井音乐节、东城区新年音乐会等重要盛会上的演出，国家大剧院、中山音乐堂、北京音乐厅等艺术殿堂里的专场音乐会、歌咏比赛，澳大利亚悉尼歌剧院、奥地利金色大厅里的精彩表演，都赢得了中外友人的美好赞誉。

未来的人才应该是具有科学精神的人才，作为北京市科技示范校学校高度重视科技教育。学校致力于探索基础教育阶段学生思维品质培养途径及培养方式，着眼于学生未来的发展，坚持在初中阶段开发学生智力潜能，培养学生智力素质的研究，通过科技节系列常规科普活动和课外科技实践活动，培养学生参与科学研究的兴趣和能力。在科技教育普及与提高的关系上，学校更重视普及，把“未来工程师”大赛、“头脑奥林匹克”竞赛和科技英语确立为五中分校科技教育的三个重要项目，融于课堂教学，兴于课外活动，展于竞赛场上，学生们兴致盎然，乐在其中。此外，五中分校还紧密结合课程改革，建立科技教育的高位平台，为有潜质的学生创设条件，引领他们走进国家重点实验室、到中国科学会堂聆听科学院院士的科普讲座，使之在浓厚的科学氛围熏陶中、在与大师的零距离接触中获益匪浅。一年一度涵盖科技小报、科技制作、科技论文、小发明等内容的校园科技博览会，成为每位同学大显身手、展示才华的大舞台；校园“环保乐队”，是学校实施科技教育的又一载体，在2009年中国国际节能减排和新能源科技博览会上，“环保乐队”受到党和国家领导人的亲切接见，对学生们使用的环保“乐器”青睐有加。胡锦涛总书记接过学生用纸牌做的笛子试吹，和学生用多功能球拍打球；温家宝总理认真聆听学生们自创的乐曲《中国加油》，对乐器蕴涵的环保理念赞不绝口……2007年，五中分校在美国夺得了全球第25届头脑创新大赛项目冠军；在全国第一届中小学生创新思维(DI)竞赛上，学校的八支代表队将全部奖牌的一半尽收囊中。自2006年，在连续五届的全国青少年未来工程师竞赛中，共获得5次团体第一名。2009年，在北京青少年科技创新大赛和北京市金鹏科技论坛两项重要的科技赛事上，又一举夺得6个一等奖。张雨婷同学在“国际青年科学家”竞赛中荣获二等奖，作为本届年龄最小的选手，受到丹麦王子的亲切接见。2009年，张一弛同学荣获中国青少年科技创新奖，成为全国唯一获此殊荣的初中学生；2009年，在评出的8名首届北京市中小学科学建议优秀奖中，郭宇锋同学为获奖者之一。

学校教育的最终目的是让生活在这里的每一位师生学会生活，学会创造幸福的生活，创造有意义的人生。基于这种认识，五中分校的干部教师以极强的使命感和责任心倾心育人，他们从对教育的全程关注和对学子的真挚关怀出发，认真践行素质教育的要义，在不断探索和创新中提高教育教学水平，把学生从作业和分数的十字架上解放下来。为此，学校提出“体验学生学习，反思自己教学，解放学生，解放自己”的工作思路，要求每一位教师深化课程改革，力求改变单调刻板的教育教学方式和学生的学习方式。为学生创造更为广阔的学习空间。学校建立了学生阅览室，开设了阅读课。语文教师指导学生创办“校园民俗文化庙会”，带领学生走进茅盾故居、走进现代文学馆。英语教师带领学生编制校园短剧，参加各种英语竞赛活动。数学教师也带领学生迈出校门、走出国门参加各种数学活动。学校还开展了丰富多彩的教育实践活动，陶艺制作、街区文化和胡同探究、“绿野寻踪、回归自然”等综合实践课。各学科教师及学校各部门通力合作，打破学科限制，连通校内校外，为学生成才创造了更大的活动空间。随着认识水平的提高，教师的业务水平也有了新的飞跃，校本教研扎实而富有成效，教学中注重学生的学习状态和情感体验，坚持评教与评学相结合，使大面积提高教学质量成为可能。在五中分校，素质教育与提高学习成绩是统一的。自2001年五中分校连续十年取得了东城区中考第一；在2009·感动东城“道德模范”评选中，学生付凯获得公德人物荣誉称号，并成为首都十大教育人物候选人之一。自2007年以来，在科技、艺术、体育、学科等各类竞赛中，学生获奖总数达到5397人次，其中：国际级奖项66人次、国家级奖项652人次、市级奖项1200人次、区级奖项3479人次。

二十一世纪是交流与合作的时代，“关注国际交往”，“走出校门，走出国门”，成为学校新一轮的工作重点。该校先后与日本枥木县真冈市大内中学、美国RobertFrostMiddleSchool学校、德国索菲·赫德维希学校结成友好学校，实行校际互访，在交流中促进，在合作中发展，让该校的老师有更深邃的目光、更博大的胸怀，让该校的学生有更活跃的思路、更创新的精神。

1998年5月，市教委批准该校在原二十三中校址试办民办公助普通初级中学—北京市第五中学分校，实现初高中脱钩。

1998年5月，经市教委批准，在原二十三中校址试办民办公助普通初级中学——北京市第五中学分校，实现初高中脱钩。

1998年9月1日，北京五中成为高中校。初中部民办公助体制北京市第五中学分校招收第一批学生。

2000年7月，北京市教委批准五中进入示范高中校建设序列。

2003年11月，经示范高中建设方案专家组评审验收，批准北京市第五中学为北京市示范高中校。

2020年5月，入选北京市中小学科技教育示范学校名单。

北京五中教育集团是推行“集团化办学”政策后东城区成立的首个教育集团，在集团化发展过程中，嵌入了九年一贯制（方家小学与五中分校）、深度联盟（北京五中与北京一中；五中分校与国子监中学）、百年文化老校发展（北京一中、方家小学）、城市副中心办学（北京五中通州校区）、区域合作办学（五中朝阳双合分校）等复杂元素，与一般教育集团、或大型教育集团差异明显。北京五中教育集团成立以来，经历了种种探索、改革，已取得了阶段性的成果。

2016年5月,“北京五中教育集团首次十二年贯通培养研讨会”在北京五中召开,会上首次发布了《北京五中教育集团办学标准》；2017年，五中分校多次承办“学生多样化成长与贯通培养”和“九年一贯制学校发展与中小衔接策略实验” 研讨会。