医院现展开床位1000张。设有肺癌、淋巴瘤、乳癌、消化道肿瘤等肿瘤内科、造血干细胞移植科、血液科、心血管内科、肾内科、呼吸科、消化科、内分泌科、普通外科、神经外科、胸外科、骨科、泌尿外科、妇科、戒毒科、麻醉科、等临床科室和各专业门诊，以及放疗、放射、病理、检验、功能检查、药剂、药理、免疫、细胞学、肿瘤分子生物学等医技科室和研究室，形成了相互配套支撑的专业学科群。是北京市公费医疗、医保（医保医疗机构代码：08110006）、涉外定点医院。

医院具有鲜明的特色优势。创建和发展了一批重点特色品牌学科：拥有全军骨髓移植中心、全军肿瘤中心、全军中毒救治中心、全军放射病治疗中心、全军采供血中心等五个全军医学专科中心。全军骨髓移植中心开展骨髓、外周血造血干细胞移植治疗血液病、实体瘤和自身免疫性疾病，现已完成骨髓和造血干细胞移植1600余例，移植存活时间最长的已超过25年，达到国内领先水平，并跻身于国际先进行列；全军中毒救治中心多次参与国内重大化学毒物中毒事故应急救援，成功救治各类中毒病人数千例，成功率达到国内先进水平；全军放射病中心承担国内重大辐射事故病人的救治，收治病人数和救治水平居国内领先，在国内率先开展非清髓异基因造血干细胞移植治疗血液病200多例，明显降低了病人的毒副作用和并发症，达到国内领先水平；全军肿瘤中心由5个肿瘤内科、7个外科、放射治疗技术科和专业实验室组成，主要收治肺癌、淋巴瘤、乳腺癌、消化道肿瘤、颅脑肿瘤、烟雾病、肝脏肿瘤、妇科肿瘤、泌尿系肿瘤和骨肿瘤，开展手术、化疗、干细胞移植治疗、免疫治疗、高强度超声聚焦刀无创治疗、术中放射治疗、适形调强放疗等综合治疗，年诊治各类肿瘤病人万余人次，诊治水平达到国内领先水平；全军采供血中心拥有先进的采供血设备，确保了临床安全用血和血细胞分离治疗。内分泌科治疗甲亢已有50多年的历史，利用同位素、碘131治疗甲亢具有独到的经验，享誉国内外。