1980年设立时原名千岁空港，运送旅客前往邻近的新千岁机场，同时也是当时国铁所设立的第一个机场联络站。1992年新千岁机场旅客中心完成后，废止旧旅客中心，千岁空港改称为南千岁。南千岁站为千岁线主线、千岁线机场支线以及石胜线三条路线汇聚的交通要冲，因此往道东、道南的特急列车均有停靠，担任札幌都市圈南部的运输任务。

JR千岁线

由北海道苫小牧市的“沼端站”至札幌市白石区的“白石站”间的铁道路线，56.6km，旅客站16站。由千岁市的“南千岁站”至“新千岁空港站”被称为支线“空港线”。在沼端站可接续室兰本线，白石站可接续函馆本线。

JR石胜线

从北海道千岁市的“南千岁站”开始，途经夕张市、一直到上川郡新得町的“新得站”之间的铁道路线，全长132.4km。名称来源于路线连接地区的旧称“石狩国”和“十胜国”。由追分站～夕张站之间被称为支线“夕张线”。