2014年，由厦门大学牵头且以台湾研究院为核心力量成立的“两岸关系和平发展协同创新中心”入选国家级“2011计划”。

2017年9月，厦门大学台湾研究院入选国家高端智库培育单位，并成为教育部高校高端智库联盟单位。

根据2018年11月研究院官网信息显示，研究院有教授13人，副教授12人，有福建省哲学社科学术咨询专家2人，福建省第六届优秀青年社会科学专家1人。

福建省哲学社科学术咨询专家：刘国深、李非

福建省第六届优秀青年社会科学专家：唐永红

根据2018年11月研究院官网信息显示，研究院设6个研究所，6个跨学科研究机构，有国家级“2011计划”1个，教育部人文社科重点研究基地1个，教育部区域与国别研究培育基地1个。

国家级“2011计划”：两岸关系和平发展协同创新中心

教育部人文社科重点研究基地：厦门大学台湾研究中心

教育部区域与国别研究培育基地：厦门大学港澳台研究中心

研究所：政治研究所、经济研究所、历史研究所、文学研究所、法律研究所、两岸关系研究所

跨学科研究机构：民进党研究中心、两岸青年研究中心、大数据与民调研究中心、涉台外交研究中心（筹）

根据2018年11月研究院官网信息显示，研究院文献信息中心入藏的图书以台版为主，有馆藏台版图书近5万册，其中外文图书6千余册；200多种过刊装订本1.6万册、20多种往年报纸装订本0.9万册。每年订购台湾地区出版的图书近千册，期刊120多种，报纸5种。有联合百科系列数据库4种、汉珍数位台湾研究系列14种、台港澳资源检索系统（期刊1700多种，全文近50万篇，学位论文近10万篇，每年更新）、台湾研究基础数据库（台湾统计数据、选举数据）、《台湾研究集刊》检索光盘等电子资源20余种。

根据2018年11月研究院官网信息显示，研究院学者出版学术专著300多部，发表学术论文3000多篇；共承担国家社会科学基金重大项目、教育部重大攻关项目及其他国家级重大项目10多项，国家社会科学基金、国家自然科学基金、教育部的重点项目和一般项目50多项；在国家以及教育部、省、市社会科学成果的各项评比中，研究院撰写的著作、论文共获得优秀科研成果奖300多项，整理出版《康熙统一台湾档案史料选辑》、《郑成功档案史料选辑》等资料档案专辑。

2018年，研究院唐桦副教授申报的项目《常住大陆台胞群体的社会融入问题与对策研究》获得国家社科基金一般项目立项，张宝蓉教授申报的项目《两岸青年交流中的群际接触与融合发展问题研究》获得教育部人文社科规划基金项目立项，陈超助理教授申报的项目《台湾青年在大陆社会融入状况研究》获2017年度教育部人文社科规划青年基金项目立项。

《台湾研究集刊》主要发表关于台湾问题的前沿研究成果，包括台湾政治、经济、法律、历史、文学、宗教、社会、教育以及两岸关系等方面的论文、书刊评介、学术综述等，已加入《中国学术期刊全文数据库》、《中国学术期刊综合评价数据库》、《中国人文社会科学引文数据库》、《中国核心期刊（遴选）数据库》、中国期刊网、万方数据库等全文数据库。

在影响因子方面，《台湾研究集刊》排在港澳台问题类刊物的第一位。从2010年第1期起，《台湾研究集刊》正式从季刊改为双月刊。

根据2018年11月研究院官网信息显示，研究院有二级学科博士点7个，二级学科硕士点10个，福建省“双一流”建设高峰学科1个。

福建省“双一流”建设高峰学科：两岸关系和平发展

二级学科博士点：区域经济学、经济法学、台湾研究、政治学理论、国际关系、中国现当代文学、中国史

二级学科硕士点：政治学理论、中外政治制度、国际关系、区域经济学、专门史、中国近现代史、中国现当代文学、宪法学与行政法学、经济法学、台湾研究

根据2018年11月研究院官网信息显示，研究院共招收博硕士研究生约600人，其中台湾学生50多人。截至2017年6月，毕业博士研究生53名，硕士研究生216名。

根据2018年11月研究院官网信息显示，研究院共有120多人次赴美、日、欧等国家或地区进行讲学、短期研究和参加研讨会，与哈佛大学、麻省理工学院、芝加哥大学、哥伦比亚大学、约翰·霍普金斯大学、马里兰大学、首尔大学、新加坡国立大学、伦敦政经学院、柏林洪堡大学、东京大学，以及布鲁金斯学会、战略与国际研究中心、兰德公司、卡内基国际和平基金会、史汀生中心、美国进步中心、英国皇家国际问题研究院、韩国统一研究院等国际知名高校和智库建立起学术交流关系，在台北、台中、高雄、金门设立四个驻点研究室。

台湾研究院院徽整体设计风格与厦门大学校徽保持一致，色调为深蓝色。

院徽主体是由大写英文字母“TW”构成的“翻开的书本”，契合本院从事台湾研究、教书育人的内涵。

书页图案为大陆和台湾的轮廓，意为“两岸一家”，中间的圆点即为本院所在地厦门。

“GIfTS”为研究院英文名称的缩写；外圈为研究院院名的中英文表述。