1930年代初，《行政诉讼法》及相关组织法公布施行，1933年正式成立行政法院，当时的行政诉讼制度采一级一审制，故只有设立行政法院一所，集初审、终审、事实审、法律审于一身。

“司法院”有鉴于此，乃于1981年7月间组成“行政诉讼制度研究修正委员会”，致力于行政诉讼制度之研修，并配合修正《行政法院组织法》，将审级制度由一级一审改为二级二审与一级一审并行之双轨制，依修正草案规定，行政法院设“中央”行政法院与地区行政法院二级，并于省、直辖市及特别区域各设置地区行政法院。

“立法院”1998年10月2日完成三读之《行政诉讼法》，改采双轨制，回归二级二审制，将行政法院分为最高及高等行政法院二级，不采“中央”及地区行政法院之划分，于1999年元月3日三读通过之行政法院组织法亦随之修正。“司法院”遂规划设置台北、台中及高雄等三所高等行政法院，须为相关筹备事宜，“司法院”乃函令《行政诉讼法》及《行政法院组织法》均于2000年7月1日施行，台北高等行政法院于是日创设成立。