1970年，毕业于北京医学院医疗系；

1984年，作为访问学者赴美国阿里桑那州凤凰城（Phoenixcity）St.Luke医学中心关节炎中心进修学习人工关节置换术的临床与基础研究工作和关节炎的外科治疗技术。回国后主攻关节病特别是类风湿关节炎、骨性关节炎、强直性脊柱炎等风湿性疾病所致关节疾患的外科治疗。

1990年，组织创建中国国内第一个以关节炎外科治疗为主的专业诊治研究中心，领导开展风湿病严重关节畸形患者的人工髋、膝关节置换术。

主编了国内第一部人工关节外科学专著《人工关节外科学》，并参与编写《风湿病学》、《现代骨科诊疗手册》等著作。国内外核心专业杂志发表学术论文100余篇。多次出国访问及参加国际会议交流，在第65届全美骨科医师年会上做大会发言，文章随后在美国骨科杂志Journal of Arthroplasty发表。所取得的成果填补了我国严重风湿病外科治疗的空白，并获得1999年北京市科技进步二等奖及2002年教育部提名国家科技进步一等奖。吕厚山教授还兼任中华风湿病学会常务委员，中华骨科学会委员，亚太人工关节学会理事，中国生物医学工程学会常务理事，北京生物医学工程学会理事长，中华医学杂志、中华外科杂志及中华风湿病学杂志编委，第六、七届国家自然科学基金委员会生命科学部学科评审专家等职务。