民国三十四年（1945年）8月抗战胜利后，回到广西担任《广西日报》柳州版总编辑。

民国三十五年（1946年），石兆棠、罗培元相继被解职，莫乃群、吴克清及两报社中的中共党员、民主人士先后被迫撤离。4月，吴克清成为中国民主同盟广西支部委员。11月，民盟桂林市分部成立，吴克清为负责人。

民国三十六年（1947年），民盟被国民党当局宣布为“非法团体”，总部被迫解散。4月，吴克清经民盟组织安排来到泰国，任由中共地下党和民盟合办的《曼谷商报》社副社长。同年7月，经民盟组织介绍来到马来西亚著名的华侨中学任教并参加当地民盟组织的革命活动。

民国三十八年（1949年）6月回国，任广东东江人民行政委员会干部及广东省人民政府办公厅交通科副科长。

1950年5月，吴克清奉命调回广西担任省民盟组织部部长兼省政协副秘书长，广西省人民政府参事，后兼任民盟南宁市委员会主任委员、南宁市政协副主席。10月，当选广西省第一届各界人民代表大会代表。

1950年至1952年，民盟广西省支部动员盟员积极投入土地改革运动，吴克清参加土改工作队区工委的领导工作。

1951年，中国人民保卫世界和平委员会广西分会成立，吴克清当举为委员。

1953年1月，参加在南宁召开了民盟广西省第一次代表大会，被选为民盟广西省支部委员会常委。同年，当选政协广西省第一届委员会常务委员。

1953年10月，各民主党派工商联组织成员参加第三届赴朝慰问团，民革广西省分部筹委会召集人陈此生任广西分团副团长，民盟广西省支部常委吴克清任副秘书长，赴朝慰问中国人民志愿军和朝鲜军民，历时3个月。

1954年8月，当选广西省第一届人民代表大会代表，任大会副秘书长。

1955年6月，民盟广西省第二次盟员代表大会在南宁召开，当选为中国民主同盟广西省支部委员会常委，任广西文化局副局长。

1955年至1958年，民盟广西省委员会发动全省盟员学习有关农业合作化的文件，推动盟员在各单位中国共产党组织领导下，下乡参观和参加农村工作，为农业的社会主义改造贡献力量，吴克清等参加了检查农村文化、生产等工作。

1958年3月，当选广西壮族自治区第一届人民代表大会代表，任大会副秘书长。是月当选政协广西壮族自治区第二届委员会常务委员。

1958年10月，广西壮族自治区成立，民盟广西省委员会相应改为民盟广西壮族自治区委员会。是月民盟广西壮族自治区第三次盟员代表大会在南宁召开，任民盟广西壮族自治区委员会秘书长。12月，当选中国民主同盟第三届中央委员会候补委员。

1962年1月，参加民盟广西壮族自治区第四次盟员代表大会，被选为民盟广西委员会常委，继任民盟广西壮族自治区委员会副秘书长。

1963年12月，当选广西壮族自治区第二届人民代表大会代表，当选政协广西壮族自治区第三届委员会常务委员。

1965年8月至1966年5月，民盟广西委员会莫乃群、石兆棠、吴克清和部份干部、盟员参加了城市(南宁、桂林)和武鸣农村的社会主义教育（即四清）运动。

1977年12月，当选政协广西壮族自治区第四届委员会常务委员。

1978年8月，当选中国人民政治协商会议第五届全国委员会委员。

1979年10月，当选中国民主同盟第四届中央委员会委员。

1980年2月，参加民盟广西壮族自治区第五次盟员代表大会，被选为民盟广西壮族自治区委员会副主任委员，兼任民盟广西壮族自治区委员会秘书长。

1981年11月，自治区政协文化组组织文物保护调查组。第一由盟员莫乃群、吴克清任正、副组长，对桂林、兴安、柳州、宜山、宁明的文物、古迹进行调查，对文物的保护、维修、抢救、开发旅游点等工作，提出了具体的意见、建议。

1981年12月，民盟广西委员会副主委吴克清到香港深亲，回来后对自治区直属机关盟员和南宁市部份盟员及所联系群众作《旅港见闻》报告。

1983年4月，出任广西区人民政府副主席。6月当选中国人民政治协商会议第六届全国委员会委员，12月当选中国民主同盟第五届中央委员会委员。

1984年4月，参加民盟广西壮族自治区第六次盟员代表大会，被选为民盟广西委员会副主委，并作了工作报告。是月，参加自治区政协五届二次会议，吴克清、王绥正联合发言，对当前自治区高校的创收问题，提出看法和建议。

1985年3月，广西壮族自治区红十字会第三次代表大会在北海市召开，选出第三届理事会领导成员，吴克清当选会长。

1985年4月，民盟广西委员会成立了“三胞”工作领导小组，由吴克清任组长，4月20日领导小组邀请在南宁的有“三胞”关系的盟员座谈，鼓励盟员积极与“三胞”加强联系。

1985年5月，被选为中国红十字会理事。

1985年7月，吴克清应邀以自治区副主席的身份，率领北海市经济代表团赴新加坡考察、访问。

1985年12月，吴克清以广西红十字会会长身份，应邀率领考察团一行7人赴芬兰考察并洽谈关于医用消毒包装袋方面的项目，返程时对香港红十字会进行为期一周的工作访问。

1986年10月，民盟广西委员会在南宁召开首次“三胞”工作座谈会，吴克清作了“民盟应多做‘三胞’工作”的报告。

1988年2月，参加民盟广西壮族自治区第七次盟员代表大会，被选为民盟广西壮族自治区委员会主任委员，致闭幕词。

1988年3月，吴克清应香港红十字会会长邵逸夫的邀请，组成4人代表团， 赴香港访问，与香港红十字会会长邵逸夫及有关人士和侨胞进行了会谈和接触。

1988年4月，当选中国人民政治协商会议第七届全国委员会委员。10月，当选中国民主同盟第六届中央委员会中央常务委员。

1989年，吴克清在自治区政协六届三次常委会上，对加强政府部门统战工作，提出了意见、建议，得到自治区党委和政府重视，自治区人民政府作出决定，要求各级政府要有一位领导分管统战工作。

1989年10月，民盟广西委员会主委吴克清等参加自治区人民政府中、小学教育工作督导检查组，到浦北县进行督导活动。

1989年11月，民盟广西委员会在南宁召开第二次“三胞”工作座谈会，吴克清主委作了《发挥盟的优势，开拓“三胞”工作新局面》的工作报告。

1990年4月，任广西区政协副主席。当选为政协广西壮族自治区委员会常委、文史资料研究委员会副主任委员、教育文化体育委员会主任委员。

1990年7月，吴克清到藤县、 平南、桂平三县对长洲水电枢纽工程可行性问题作进一步调查。并写出《关于长洲水电枢纽水库淹没区藤县、平南、桂平补偿问题的调查报告》。

1992年10月，到平南县城乡进行视察，并参加大瑶山区八县政协联谊会筹备会议。是月当选中国民主同盟第七届中央委员会中央常务委员。

1994年3月，《广西通志·民主党派志》民盟篇评稿会召开，吴克清作为区民盟老领导参加了评稿。

1997年6月，民盟广西壮族自治区第九次代表大会在南宁市举行，吴克清当选民盟广西壮族自治区第九届委员会为名誉主任委员。

1998年8月离职休养。

2007年5月5日5时40分在南宁逝世，享年91岁。

民盟广西地方组织最早是成立于1942年9月的中国民主政团同盟桂林核心小组，以梁漱溟为首的桂林核心小组主要在两广从事抗日、民主的宣传活动。1945年春，民盟分别在八步、昭平、黄姚等地进行了抗日、民主的宣传，出版了《民宪》杂志（广西版）和《广西日报》（昭平版），筹办黄姚中学，举办民主讲座和话剧等，大力开展抗日救亡宣传活动。1945年8月抗战胜利后，应其大学同学、中共地下党员、广西《柳州日报》总编辑和社长罗培元邀请，吴克清回到广西担任《广西日报》柳州版总编辑，后由民盟广西省支部安排进入《广西日报》任副总编辑，写了不少社论、时评及专论，配合民盟组织开展工作。编辑的两报坚持进步立场，反对蒋介石的内战独裁政策，为广西当局所不满。

广西《柳州日报》名义上是国民党办的，实为中国共产党掌握，成为西南地区抗日进步的一面旗帜。这张报纸报纸通过新闻 、 社论 、文艺作品积极而巧妙地宣传党的民族统一战线 、方针 、政策，揭露黑暗势力，鞭挞投降主义路线，当时中国共产党办的极为重要的报纸《新华日报》（地址重庆），就曾多次转载过《柳州日报》的社论，使之成为华南地区较有名气的报纸。

1945年11月，中国民主同盟广西支部在桂林成立，盟员300多人，吴克清成为负责人之一。1946年4月被增补为支部委员，负责积极开展宣传民盟的政治主张工作。1946年5月，吴克清同志（民盟盟员）作为《广西日报》的副总编辑，及时处理以《师范学院纪念“五四”》为题的新闻稿件，保护了民盟及其他先进人士，揭穿和击败了广西省桂系的特务想借助新闻通稿的打击镇压民主阴谋。

新中国成立后，民盟积极参加社会主义革命和建设。1953年，吴克清成为民盟广西省支部委员会常委。积极参与革命建设工作，撰写过《大力贯彻百花齐放、百家争鸣的方针》等多篇对广西文化建设和发展颇有影响的文章。

1953年至1980年，吴克清作为民盟广西省支部委员会常委，参加了检查农村文化、生产，参加了城市（南宁、桂林）和武鸣农村的社会主义教育（即四清）运动等社会主义革命和建设工作。在参与思想建设、政治建设活动会议中，先后作了“百家争鸣与百花齐放问题”、“对当前自治区高校的创收问题，提出看法和建议”的发言，为巩固和发展安定团结的政治局面，促进社会主义革命和建设作奉献。

1980年2月，吴克清被选为民盟广西委员会副主委，在担任民盟广西委员会第五、六届副主委期间，参与提出了关于建立出海“大通道”的建议，通过对桂林、兴安、柳州、宜山、宁明的文物、古迹进行调查，对文物的保护、维修、抢救、开发旅游点等工作提出了具体的意见、建议。积极参与地方建设工作，结合自身特点，在教育改革、科技咨询、智力支边和教育扶贫等方面做出了贡献。1988年2月，在民盟广西壮族自治区第七次盟员代表大会上被选为民盟广西委员会主委，在担任民盟广西委员会第七、八届主委期间，带领民盟广西区委提出了“需要重视和加大基础教育投入的建议”、“对当前自治区高校的创收问题，提出看法和建议”、“对加强政府部门统战工作，提出了意见、建议”。 积极参政议政，认真建言献策，就广西的经济建设和社会发展问题，做了大量的建设工作。

1990年4月，在第七届委员会议第三次会议，吴克清被增选为自治区政协副主席，对自治区大政方针和人民群众普遍关心的重大问题，进行认真深入的讨论发言。1993年1月，在第七届委员会议第一次会议，吴克清在发言中提出：民主党派和社会团体办学，任何单位不应向他们征收任何费用。1994年1月，在第七届委员会议第一次会议，吴克清委员代表民盟广西委员会提出建议：“各市县建立教育基金会，借鉴广东东莞市的好经验”。通过政治协商积极参与地方事务的管理，围绕广西经济和社会发展的中长期规划，地方法律法规的制定以及广西政治、经济、文化发展状况等问题调查研究和建言献策。

吴克清作为民盟广西委员会的领导，还担任广西壮族自治区人民政府副主席、政协副主席，带领过广西民盟积极参与经济统战工作，积极参与文化统战工作，积极参与和谐统战工作，构建和谐的政党关系，协助党委政府做好理顺情绪，化解矛盾的工作，促进广西和谐稳定发展。

1946年5月4日，桂林文协和师范学院专门搞了一个纪念“五四”运动的活动。据吴克清回忆，活动结束后，广西省桂系的特务头子梁学基就给广西日报社送去了一篇新闻通稿，诬蔑欧阳予倩、林励儒、靳为霖等说美国的救济面粉有毒，劝大家不要吃，并说美国 给中国捐粮食是想把中国变成他的殖民地等。美国的救援物资当然没有毒，但是，当时广西很多地方都在闹饥荒，粮食非常珍贵，特务们只是想通过方式，让这些人士替他们背上政治的黑锅。吴克清作为当时副总编辑，认为报道与事实不符，经争取同意后对原稿内容作了删改。

《桂林解放》一书中文章”回忆《民主》星期刊（桂林版）的出版“后记：因任《广西日报》副总编辑（盟员）吴克清同志当时抵制最力，这次被称为的“面粉有毒事件”就这样被我们揭穿和击败了。

1946年5月5日，《广西日报》报道了“靳氏警告国人不要随便接受外国人救济”简单的一段话，到《中央日报》的笔下被诬蔑为说联合国的救济面粉有毒不能吃，要广西灾民饿死。民盟广西省支部研究后由靳为霖致函《广西日报》要求更正该报所发表的失实的新闻报道，在《广西日报》副总编辑盟员吴克清同志的支持下，靳为霖的信以来函照登的方式为之发表。但在排版后，被该报副总经理特务分子陈学涵叫人抽掉了。吴克清同志深夜看报纸的大样时，发现了这一情况，又果断地叫工人补排了上去。靳为霖的来函见报后，让人们看到《广西日报》自己打了自己的嘴巴，无异于承认了报道失实；尤其是使《中央日报》（广西版）的社论，失去了立论的根据，国民党CC分子和桂系特务联合策动的迫害桂林民主人士、镇压民主运动、打击《民主》（桂林版）的阴谋，从而更加暴露在光天化日之下。

曾任民盟安徽省委副主委的丘林收录在《风范长存》民盟广西前辈纪念文集的文章《回忆在桂林的一段经历》中对”入盟的介绍人之一“吴克清是这样评：“1946年夏，我因在昆明《观察报》上发表的两篇反对内战的文章，已成为追查的目标；只好向在两广地区工作的朋友们发出几封求援信件，最先接到的是当时在桂林《广西日报》任副总编辑的吴克清的复信帮助，得以及时同杨昌辉离开昆明摆脱国民党反动当局追查，并出任《广西日报》编辑兼记者，得以继续发起民主的进攻。”

1987年，广西平南县政府重建明督师袁崇焕“总制三边坊”，高13.38米，坊碑上有仿古图案，由时任广西壮族自治区人民政府副主席吴克清题写坊名。

在庆祝广西戏剧展览会隆重开幕的题字：

西南剧展四十秋，艺苑丰功史册留。

今岁群英齐荟萃，务期更上一层楼。

广西民盟网的评价为：“吴克清是民盟早期的革命活动家，撰写过《大力贯彻百花齐放、百家争鸣的方针》等多篇对广西文化建设和发展颇有影响的文章。”

柳州报业的记实评价为：“在《广西日报》（柳州版）改版初期，进步人士吴克清被聘任总编辑，写了不少社论、时评及专论配合组织开展工作，给时人《广西日报》（柳州版）乃是一张民主进步色彩报纸的印象。

广西民盟组织早期负责人之一靳为霖评：“在1946年五四统稿事件中，任《广西日报》副总编辑（盟员）吴克清同志当时抵制最力。”

曾任民盟安徽省委副主委的丘林评：“在桂林的一段经历日子，获得了包括吴克清等一批进步人士珍贵的同情和支援，这是我永远忘却不了的。”

《柳州日报》记者宋泽文评：“自治区人民政府副主席吴克清（原总编辑）作为《柳州日报》老报人之一，为柳州报社曾有过那么辉煌的历史作出过卓越贡献。”