道光九年，吴其濬守孝期满回京，初任教习庶吉士，充日讲起居注官（1829年）。十一年，在南书房当值（1831年），后历官湖北学政、太子洗马、鸿胪寺卿、通政司副使，越级提拔为内阁学士。道光二十年奉令到湖北按察（1840年），查实湖广总督周天爵任人不当，逼死人命，其子违例用人等事，诏令周天爵革职流放伊犁，其巡抚以下分别受降职处分，吴其浚代湖广总督，后实授湖南巡抚。两年后，剿灭崇阳钟人杰起义，被记功优叙。次年调浙江（1843年），未行，值武冈(今湖南武冈县)小股农民起义，剿灭后，调云南巡抚代云贵总督。

道光二十五年（1845年）调福建巡抚，改山西巡抚翰林院入直南书房，存跻卿贰，外擢巡抚，学优守洁，办事认真，兹闻溘逝，殊深轸惜，著封赏，加封太子太保衔，照巡抚例赐恤，寻赐祭葬。”

朝廷因吴其濬在山西巡抚任内改革盐法，克己奉公，特别加恩其子孙以表彰他的廉洁清正。为此，其子吴元禧、吴崇恩、吴荣禧当即分别实授主簿、知县、通判官职。其子吴承恩、吴洪恩，其孙吴樽让皆赐举人出身。吴其濬为官清勤廉正，泽被五子一孙，成为当时盛事佳话，其家族也达兴旺极点。

吴其濬不同于清代一般官吏，他对植物学与矿产学有深厚的造诣，著有《植物名实图考》、《植物名实图考长篇》、《滇南矿厂图略》和《滇行纪程集》等书。这些书都有很高的学术价值。

吴其濬的《植物名实图考》在植物学上所取得的成就甚至大于他作为一名清代封疆大吏的历史影响，清道光二十八年该书木刻本出版（1848年），该书的问世把我国传统植物学提升到一个新的水平，并对世界植物学界产生深刻影响。19世纪70— 80年代，流传到法国、日本等地，至今仍是植物学和中医学的重要著作。

著有《植物名实图考》38卷。计引植物1714种，不仅是记述植物药品的巨著，对现代采集药物和植物分类的鉴定工作亦大有帮助。其科学价值，一是纠正了一些本草学家的错误；二是附图特别精确；三是很多植物后来中名定名以其为依据。还编著有《植物名实图考长编》22卷（收录植物838种）、《云南矿产工器图略》、《滇南矿厂舆程图》、《滇行纪程集》、《军政辑要录》、《奏议存汇》、《治淮上游论》、《念余阁诗钞》及《弹谱》等。

他留心观察各地植物，依据耳闻目见并辑录古籍中的有关记载，积30年之功，著成《植物名实图考》和《植物名实图考长编》两书。前者开中国现代植物志之先河，在中国植物学史上占有重要地位。他研究植物，强调“目验”，反对“耳食”。例如，他在山西任职时，就注意到《山西通志》上所谓山西不产党参的说法与实际不符。他发现山西不仅野外盛产党参，而且还有人工栽培。他指出党参“蔓生，叶不对，节大如手指，野生者根有白汁，秋开花如沙参，花色青白，土人种之为利”。他还派人到深山掘得党参的幼苗，进行人工栽培和观察，发现“亦易繁衍，细察其状，颇似初生苜蓿，而气味则近黄耆”。他将历代古籍中有关植物的种种记载和论述汇编为《植物名实图考长编》，收载植物838种。这不仅为自己进一步研究各种植物，撰写《植物名实图考》准备了必要的史料，而且也为后人查阅中国植物文献史料，提供了方便。

《植物名实图考》全书38卷，记载植物1714种，比《本草纲目》所载植物增加了500多种（见李时珍）；它所收录的植物遍及中国19个省。其所记植物地域范围之广和种类之多，都远远超过历代本草。吴其濬参考了李时珍《本草纲目》中的植物分类方法，但又作了很大改进。《植物名实图考》分植物为：谷、蔬、山草、隰草、石草、水草、蔓草、芳草、毒草、群芳、果、木等12类，比之前人更为简洁、合理。在每一类下，记述若干种植物，包括名称、形态、颜色、性味、产地及用途等，力求与实际情况一致。他通过亲身调查和对古籍的考证，纠正了前人文献中许多名不符实的错误记载。《植物名实图考》中，每一种植物的描述都配有根据实物绘成的植物图。有些图精确程度可资鉴定科和目，有的甚至可到种。《植物名实图考》不同于历代的本草书，它开始摆脱了单纯实用性而向着植物学著作过渡，很接近现代的植物志，为后人进一步研究中国植物，提供了宝贵资料。现代许多植物学家，还常借助它来确定某些植物的中文名称和了解其用途，受到了国内外学者的推崇，并被广为引用。

吴其濬墓被公布为第二批河南省文物保护单位（1986年11月21日公布），吴其濬故居、固始吴氏世大夫祠为吴其濬墓附属文物。此外，吴其濬曾在固始县城东郊开辟“东墅植物园”，作为栽培、研究植物的实验地。

吴其濬墓位于今河南省固始县秀水街道大皮村境内。墓园初建时占地五亩，四周有围墙、碑林、石坊、祭堂、墓前排列有石人、石马等石雕，并有专人守园。后经战乱，屡遭破坏，现存墓冢一座。

吴其濬故居（“状元府”）位于今河南省固始县蓼城街道中山大街21号，该处也是吴其濬的出生地。宅第坐落在原固始县城东门内，沿街本有门楼三间，门前有两根木柱，上面各有一木方斗，称“阀阅门”，是世宦门第的标志。飞燕鸣叫的插花兽门楼，高大宽敞，上挂清仁宗（嘉庆）皇帝御笔亲书的“状元”匾。大门两侧有一对青石雕刻的雄狮，进门是一面照壁，然后是天井院，分东院门、西院门和正门三个住宅，吴其濬祖父吴延瑞居中。宅第有前厅、中厅、后堂、内宅和“清芬书屋”。长子吴湳住东院，次子吴烜（吴其濬父亲）住西院。进西院是五间接官厅。客厅陈设素雅，正上方悬挂一块深兰色的横匾，书写金色的三个大字“宫保第”，厅东边有一小院，是吴其濬的书房，名“念余阁”。吴其濬的诗集就是以这个书房题名为《念余阁诗钞》。厅后是内宅，堂楼西有三间读书楼，名“绿云轩”。吴其濬故居现存堂楼和读书楼“绿云轩”。楼房为青砖小瓦，木架结构，前后廊为石基木立柱，二楼走廊为木花格护栏，门窗砖雕饰及结构，吸收了欧洲建筑的特点，整个建筑具有典型的清代建筑特征。为河南省重点文物保护单位—— 吴其濬墓的附属文物之一。

吴氏世大夫祠是吴其濬祖父吴延瑞在乾隆四十七年在城内北后街创建（1782年），于次年竣工。吴氏世大夫祠祠规规定：吴氏后裔生前没有大夫职衔的，死后不能入祠。祠堂前后五层，有正殿、后殿、香火殿等，并有旁宅院落为祠堂服务。吴氏世大夫祠现存正殿五间，建筑为青砖灰瓦，木框架结构，前廊为方石立柱。殿高4.5米，长20米，深8米，面积160平方米。祠堂中置香案，存放牌位，挂有吴氏祖先画像，是吴氏族人祭拜祖先的地方。

东墅植物园位于今固始县城东南郊外李家花园村。吴其濬曾为守孝居乡八年。其间，他选择固始城东史河湾地十多亩，辟建植物园，取名“东墅”（即今天俗称的李家花园）。“植桃八百，种柳三千”，“编槿为篱，种菜数亩，”“经营三四年，绿覆半墅”。东墅是吴其濬研究植物的场地。门前对联书写：“荒地十亩亦种奇花亦种菜，茅屋数间半藏农具半藏书”。一年洪水爆发，东墅被淹，他带粮溯史河而上，进入大别山腹地考察水患的原因，并写出《治淮上游论》，亦颇有建树。

固始县第二初级中学

固始县第二初级中学的旧址为“固始私立思源女子中学”。1940年夏，固始城关“思源堂”吴氏族长吴述先（清末举人，清代著名植物学家、嘉庆二十二年状元吴其濬之嫡孙，曾任江西省都昌、瑞金等县县令，后辞官还乡）召集吴氏族人，提议用吴氏士大夫祠（吴氏宗祠）之田稞1800石筹办固始思源女中。1941年夏，经固始县国民政府批准，学校定名为“固始私立思源女子中学”，首期招生1个班，共42名女生，由吴述先任校长，吴勉之任教育科长，吴氏族人吴维颐、吴维庚、吴高翼等担任语、数、外等学科的教学工作。1943年5月，吴述先辞去校长职务，任名誉校长，校长由吴高准接任。1946年，学校更名为“固始私立思源初级中学”，开始男女兼收，春季招收女生1个班，秋季招收男生1个班。学校分男生院和女生院，女生院在校本部上课，男生院在吴氏同生庄（吴氏祠堂）上课，只有在每周一的纪念周早会时，男女生方可聚为一堂。

1948年固始解放后，思源中学积极响应党的号召，为新中国的建立做了大量卓有成效的工作。学校成立了学生自治会，一批思想进步的学生通过排演新剧、学唱革命歌曲等形式上街进行宣传，当时在宣传马列主义思想、支援正在进行的淮海战役、稳定人民新政权等方面起到了积极作用。1949年春，学校由学生会提议，校领导同意，并报县政府教育科批准，实行男女生合班上课。同年秋，学校并入固始县初级中学，思源中学停止招生。

祖父：广东按察使吴延端

父：光禄大夫礼部右侍郎吴烜

伯叔：吴邦治、吴邦墉

亲兄弟：兵部侍郎吴其彦（兵部尚书戴联奎婿）、吴炘

堂兄弟：吴其浚、吴其泰

子：吴元禧、吴崇恩、吴荣禧

侄：江西按察使吴集禧、总督吴元炳等