2000年11月，周清明任湖南农业大学党委委员、党委副书记、校长。

2013年5月8日－2018年12月21日，周清明任湖南农业大学党委委员、党委书记。

截至2014年11月，周清明参加选育且通过省级品种审定委员会审定的作物品种5个，累计推广面积达33万公顷，新增经济效益3亿元以上，其中汕优198被评为“国家水稻工程”中标品种（组合）。

截至2014年11月，周清明先后主编专著4部，参编著作1部。

据2020年3月中国知网官方显示，周清明先后在《中国烟草学报》《EntomolGener》《中国水稻科学》《中国高等教育》《湖南内参》《湖南日报》等刊物上公开发表教学、科研、管理等论文306篇。

代表论文如下：

1，杨虹琦,周冀衡,杨述元,王勇,周清明,罗泽民.不同产区烤烟中主要潜香型物质对评吸质量的影响研究[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2005(01):11-14.

2，彭新辉,易建华,周清明.气候对烤烟内在质量的影响研究进展[J].中国烟草科学,2009,30(01):68-72.

3，周昆,周清明,胡晓兰.烤烟香气物质研究进展[J].中国烟草科学,2008(02):58-61.

4，邓小华,谢鹏飞,彭新辉,易建华,周冀衡,周清明,蒲文宣,代远刚.土壤和气候及其互作对湖南烤烟部分中性挥发性香气物质含量的影响[J].应用生态学报,2010,21(08):2063-2071.

5，曹十芙,周清明.中国高校本科生导师制研究进展[J].高等农业教育,2006(02):55-58.

6，谭周进,李倩,陈冬林,周清明,肖启明,李建国.稻草还田对晚稻土微生物及酶活性的影响[J].生态学报,2006(10):3385-3392.

7，谭周进,李倩,李建国,屠乃美,肖启明,周清明,陈萱.稻草还田量对晚稻土微生物数量及活度的动态影响[J].农业环境科学学报,2006(03):670-673.

8，彭新辉,邓小华,易建华,蒲文宣,周冀衡,周清明,代远刚.气候和土壤及其互作对烟叶物理性状的影响[J].烟草科技,2010(02):48-54.

9，易建华,彭新辉,邓小华,周清明,蒲文宣,周冀衡.气候和土壤及其互作对湖南烤烟还原糖、烟碱和总氮含量的影响[J].生态学报,2010,30(16):4467-4475.

10，邓小华,陈冬林,周冀衡,周清明,赵松义.烤烟物理性状与焦油量的相关、通径及回归分析[J].烟草科技,2009(07):53-56.

截至2014年11月，周清明先后主持各类科研课题20多项，其中中国自然科学基金课题2项，教育部重点项目1项，农业部项目1项，湖南省“十五”重大公关项目1项。

截至2015年6月，周清明先后获得国家知识产权局批准授权专利13项。

截至2014年11月，周清明先后获省科技进步一等奖、二等奖、四等奖各1项，三等奖3项，社会科学优秀成果二等奖2项，省教育科学研究优秀成果奖二等奖1项。

截至2014年11月，周清明先后已指导培养博士后12名、博士研究生23名、各类硕士研究生90多名。

周清明先后为博士生、硕士生、本专科生主讲高级作物育种专题、烟草育种学、国家粮食安全问题、高校管理与发展趋势专题等课程。

周清明同志政治坚定，能够认真贯彻上级党组织指示精神，始终与党中央保持一致；有较高的学术造诣，学科上有所建树；为人直率，敢于负责、敢于担当。（时任湖南省委组织部副部长李宗文评）

周清明同志政治品质好，大局观念强，对党忠诚可靠，坚持正确办学方向，党建责任意识强；领导经验丰富，对学校情况熟悉，驾驭大局和带班领队的能力强；工作有思路、有魄力、有方法，敢说敢做，为人正派，坚持原则，廉洁自律好，在学校干部群众中威信较高。（湖南农业大学宣传部评）

周清明长期担任湖南农业大学的校长、书记，对大学发展、农业院校的发展规律认识深刻，推动发展的实践经验非常丰富。（山西农业大学评）