1260年忽必烈即位大汗并建元“中统”，1271年忽必烈取《易经》“大哉乾元”之意改国号为大元，随后逐步消灭金朝、西夏、大理等国，1276年攻占临安，南宋覆亡。1279年经崖山海战后消灭南宋残余势力，全面占领中国，结束了自五代以来的分裂局面。后对外扩张，但在侵略日本、东南亚诸国却屡次失利，其中在元日战争战败。中期皇位频繁更迭，政治始终没有上轨道。经济也未恢复到宋朝时期的水平，但是仍有发展。

后期因统治腐败，宰相专权和内乱频发和民族矛盾过深，导致大规模的农民起义，各地人民纷纷起兵反抗元朝暴政，1368年朱元璋领导的农民军攻占南京，改国号为大明，正式建明称帝，随后明军北伐，占领元大都。元朝在中国的统治结束，元政权退居漠北称北元。1402年元臣鬼力赤篡位建国鞑靼，北元亡。

元朝的疆域空前广阔，北至北海、东到日本海，在澎湖列岛设置巡检司。元朝实行一省制，在中央设中书省，左右丞相和平章政事处理政务。地方实行行省制度，开中国行省制度之先河。商品经济和海外贸易较繁荣，其整体生产力不如宋朝，期间出现了元曲和散曲等文化形式。

明朝（1368年－1644年）是中国历史上最后一个由汉族建立的中原王朝。历经十二世、十六位皇帝，国祚二百七十六年。

1368年明太祖朱元璋在南京应天府称帝，国号大明。因明朝的皇帝姓朱，故又称朱明。明初定都于应天府，1421年迁都至顺天府，而在应天府设立南直隶。明朝前期国力强盛，开创了洪武之治、永乐盛世、仁宣之治和弘治中兴等盛世，国力达到全盛，疆域辽阔。中后期由于政治腐败和天灾导致国力下降，爆发农民起义。1644年，李自成攻入北京，崇祯帝朱由检于煤山自缢。明朝宗室在江南建立南明政权，随后满清趁乱入关，击败李自成农民军和南明政权，1662年永历帝朱由榔被杀，南明灭亡。1683年清军攻占台湾，明郑结束。

明朝疆域囊括内地十八省之范围，初年东北抵日本海、外兴安岭、黑龙江流域诸部落有宗主权，后缩为辽河流域；初年北达戈壁沙漠一带，后撤今长城；西北至新疆哈密，后改为嘉峪关；并曾在今满洲、新疆东部、西藏等地设有羁縻机构。明成祖时期曾短暂收复安南，1424年，明朝领土面积达到约1100万平方公里。

明朝时期手工业和商品经济发达、经济繁荣，出现商业集镇，部分学者认为明朝后期还出现了资本主义萌芽。文化艺术呈现世俗化趋势。人口方面，《明实录》所载明朝人口有7000余万，但许多学者认为实际上逾亿，也有人指出明末人口接近两亿。

明朝是继汉唐宋后又一个强盛的中原王朝。明代，虽特务横行，奸宦弄权，但无汉之外戚、唐之藩镇、宋之岁币，天子守国门，君主死社稷。清朝官修史书《明史》中评价明朝是“治隆唐宋”、“远迈汉唐”。

清朝（1636年－1912年）是中国历史上第二个由少数民族建立的统一政权，也是中国最后一个封建帝制王朝。从后金建立开始算起，共有十二帝，国祚276年。

1616年，建州女真部首领努尔哈赤建立后金，1618年，努尔哈赤以“七大恨”告天，开始发动对明朝的进攻。1636年，皇太极改国号为大清。1644年明末农民将领李自成攻占北京，明朝覆亡。摄政王多尔衮率领清军趁势入关，政治上推行剃发易服，军事上打击农民军和南明诸政权，逐步征服汉地。历经康雍乾三朝，发展到鼎峰。这一时期统一多民族国家得到巩固，基本上奠定了中国版图，同时君主专制发展到顶峰。

但是中后期由于政治僵化、文化专制、闭关锁国、思想停滞逐步落后于世界。1840年爆发了中英鸦片战争，多遭列强入侵，主权严重丧失。第二次鸦片战争之后开始了近代化的探索，地主阶级进行了洋务运动。甲午战争之后民族危机进一步加深，以康梁为首的维新派开始进行戊戌变法，但是变法失败。1900年夏天八国联军为了镇压义和团运动维护在华利益侵略中国。中国彻底沦为半殖民地半封建社会。1911年，辛亥革命爆发，清朝统治瓦解，1912年2月12日，清帝被迫退位。从此结束了中国两千多年来的封建帝制。