明万历年间(1573－1620年)由虐道德禅师创建，初名“降龙院”，左与伏虎寺遥相呼应。清初，住持僧元亨禅师德高望重，声闻胡廷。康熙壬午年（1702年），清圣祖爱新觉罗.玄烨据佛经曰：“善哉？觉哉？”赐“善觉寺”匾额，并赐联曰:“到处花为雨，行时杖出泉。”另赐《金刚经》一部，玉印一杖，其文为:“普贤愿王法宝”。康熙帝还御制四言诗一首，赐元亨大师，似彰其德。元亨大师感念皇恩，在寺内建起一座八角楼亭，塑供康熙皇帝之像，入称“厌熙亭”。而今楼亭虽废，遗啧犹存，拟待修复。

“文化大革命”中，善觉寺无僧人管理，由当地晨民占用。“文革”后，落实宗教政策，政府将该寺归还佛教协会管理。此时善觉寺殿堂破败，佛像全无，一片凄凉冷落。

1989年3月，市佛教协会委派比丘尼宏智法师到善觉寺任住持，恢复寺中正常佛事活动。宏智法师发十年宏愿募资修复，十方信众康慨捐献，共襄盛举。十年来，整修危房，增建殿堂，重塑佛像，使降龙古刹焕然一新。现有四重大殿及客堂、禅堂、僧寮、齐堂等建筑，宽敞华丽，庄严雄伟，远胜当年。善觉寺修复工程先后耗资一百万元。并免费向十分信众开放。