1774年祁主教(Alexandre da Silva Pedrosa Guimarães)来澳门任职时，修院已经没有修生，而成为一座孤儿院。1783年，高维牙主教邀请遣使会司铎数人来澳门重新开办修院，并于1784年开学，招收修生8名，经过艰苦的工作，修生人数大增。但到了1833年，由于查主教(Francisco de Nossa senhora da LuzChacim)迫走遣使会会士，修院的教授又逐渐星散殆尽，到了名存实亡的地步。直至1862年，葡萄牙政府批准了马杰罗主教(Jerònimo José da Mata)关于准许耶稣会士重回修院担任教职的请求，修院修生即骤然增加。1871年后，由于澳门总督府派遣政府敎师到修院任教，修院便变成一所市立中学 ：利宵中学前身。1893年利宵中学建校后，始改为一座专研神学的修院，为在澳门以至中国的传教事业作出贡献。该修院自创办以来，培训了数百名天主教的神职人员，为在澳门以至内地继续开展传教事务作出了贡献。