1969年4月26日，农一师党委决定撤销塔里木农垦大学建制，原校址改为农一师毛泽东思想学习班，学校教师除少部分留在学习班外，大部分被分配到塔里木河南岸各团场参加劳动。

1975年5月，新疆维吾尔自治区党委决定在巴楚县成立南疆农学院。

1975年12月13日，阿克苏地委决定在原塔里木农垦大学校址成立南疆农学院塔里木教学点，规格为县级，并开始招收工农兵学员（即普通班）。设农学系、农田水利工程系、农业机械系、畜牧兽医系。

1976年3月，开始招收第一期109名工农兵学员；同年10月又招收第二期学员116名，到1977年底共招收农学、水利、果树、农机、畜牧等5个专业8个普通班。

1976年8月26日，新疆维吾尔自治区党委决定撤销南疆农学院塔里木教学点，恢复塔里木农垦大学，由阿克苏地区领导。

1978年12月28日，教育部报经国务院批准同意恢复塔里木农垦大学为普通高等农业院校。

1979年10月，学校升格为地（州）级，属自治区领导。

1982年1月，新疆维吾尔自治区教育厅发文公布该校为国务院学位委员会确定的首批具有学士学位授予权的高等学校。

1982年6月，国家恢复新疆生产建设兵团建制，学校又划归兵团领导。

1983年6月，原农牧渔业部决定并报请国务院批准，塔里木农垦大学实行农牧渔业部和新疆维吾尔自治区双重领导，以部为主的领导体制。

1998年6月，学校进行教学改革，把教学单位按照大学科重组，成立了植物科技学院、动物科技学院、农业工程学院、人文科学系、公共课部、成人教育学院。

1999年9月，学校成立高等职业技术学院。

2001年7月，撤消人文系和公共课部，成立文理学院。

2003年，获得硕士学位授予权；9月，成立信息工程学院和经济与管理学院。

2004年5月，经教育部批准，塔里木农垦大学更名为塔里木大学。

2007年，在教育部本科教学水平评估中被评为“优秀”。

2017年，成为“教育部创新创业示范高校”。

2018年，获博士学位授予权。

2018年，石河子大学医学院（塔里木大学）分院成立，是由新疆生产建设兵团批准，石河子大学与塔里木大学采取合作办学的方式组建而成的医学院校。

2019年，进入教育部第二批“三全育人”综合改革试点高校。

2021年6月1日，第一师阿拉尔医院正式成为石河子大学医学院（塔里木大学）分院教学医院。

2021年10月，塔里木大学医学院成立。

2022年3月3日，塔里木大学新校区启用仪式在新校区主教学楼正南门前举行。

2023年11月，组建成立兵团农机装备制造业创新中心。

2024年9月25日，塔里木大学获赠天安门广场国旗。

据2024年3月学校官网显示，学校设有16个学院，开设92个本科专业。

截至2024年3月，学校现有教职工1500余人。

据2024年3月学校官网显示，学校有4个自治区重点学科，9个兵团重点建设学科，1个一级学科博士学位授权点，23个硕士学位授权点。

截止2024年3月学校官网显示，学校有1个教育部重点实验室，11个省级重点实验室，3个省级工程实验室，2个兵团协同创新（培育）中心，3个省级人文社科重点研究基地，1个兵团国际科技合作基地。国家一流本科专业建设点6个、省级一流本科专业建设点21个。

2019—2020学年，学校学生获得国家级奖项65项，省部级奖项212项。在第六届兵团互联网+大学生创新创业大赛上，学校共获得兵团一等奖4项、二等奖2项、三等奖13项、最具创意奖1项、精准扶贫奖1项、逐梦小康奖1项，其中《凝“核”聚力—扶贫成效再提升》团队首次入围全国决赛，并在全国总决赛中斩获银奖。《披“沙”拣金，惠享万家基于绿色环保的生态种植模式》《日光温室水幕地暖加温设备》入围第十二届“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛全国总决赛。

据2024年3月学校官网显示，学校有1个国家工程实验室，1个兵团与科技部共建国家重点实验室培育基地，4个省级重点实验室，3个省级工程实验室，2个兵团协同创新（培育）中心，3个农业部试验站，2个省级人文社科重点研究基地。

截至2024年4月，学校共承担各级各类科研项目1783项，其中国家社科基金重大招标项目1项，国家级、省部级项目786项；出版专著教材143部，发表SCI论文670篇。

据2022年7月学校官网显示，学校图书馆建筑面积36000平米，共有图书260.5万册，其中纸质图书155.5万册，电子图书105万种，每年订购中外文报刊约600种，引进了近30个中外文数据库，存储设备容量占80T。

《塔里木大学学报》是由塔里木大学主办的自然科学综合性学术期刊，主要刊登微生物学、农学•植物保护、园艺•林学、畜牧•兽医、生态•资源•环境、化工•材料、食品、农业工程等突出南疆地区农业科技及区域社会经济特色的基础研究与应用研究方面的学术论文，并酌登高水平综述文章；2014年7月，“塔里木生物资源研究”栏目获评全国高等农业院校学报研究会“特色栏目奖”；2016年10月，获评中国高校科技期刊研究会“2016年度中国高校优秀科技期刊奖”。

据2022年7月学校官网显示，学校与20余所中国国（境）外高校建立了交流合作关系；与新疆各地州、县和兵团各师、农牧团场紧密联系，走产、学、研相结合的道路，开展科技服务扶贫，“百名科技特派员、千名学生下基层”团队和20多个科技服务专家团队常年活跃在南疆基层。每年组织“万名学生三下乡”社会实践活动。长期为南疆中小学教师和基层干部开展双语培训。2010年教育部启动团队式对口支援工作，中国农业大学、浙江大学、华中农业大学、北京化工大学、东华大学团队式对口支援学校取得实效，与西北农林科技大学、东北农业大学、兰州大学、武汉大学、南京农业大学等高校建立了合作关系，与中国农科院“十一所一院”建立了全方位实质性合作关系。

2024年5月，由青海省生产力促进中心有限公司、西安技术经理人协会、兰州科技大市场管理有限责任公司、塔里木大学、宁夏职业技术学院5家单位联合发起组建的西北技术转移人才培养联盟在西宁正式成立。

自强不息、求真务实

艰苦创业、民族团结、求真务实、励志图强

艰苦奋斗、自强不息、扎根边疆、甘于奉献

2022年9月23日上午，塔里木大学举办庆祝中国农民丰收节暨学校第五届采摘节，活动向全校师生同步线上直播 。

2023年5月3日，塔里木大学举行2023年五四青年节表彰大会暨第八届胡杨文化艺术节。

截至2024年3月，学校官网显示，塔里木大学占地面积3872亩，校舍建筑面积103.32万平方米，分校本部校区和东扩校区两个校区。学校法定驻地是新疆维吾尔自治区阿拉尔市塔里木大道1487号。

塔里木大学有鳞次栉比的大楼，绿树成荫的小径，花香四溢的果园，成群结队的蝴蝶，它的大绝不仅仅只有空间的大，它还是一所桃李周庭的大学。

塔里木大学图书馆位于综合楼北面和校建筑群的主轴线上。桂殿兰宫般的建筑，是学校最有代表性的建筑物之一。内设六层，内涵中文数据库、外文数据库、新语听书馆、超星图书以及各类图书学习资料等海量资源。图书馆外形设计有两种不同的色系，视觉上就像两个胡杨根紧紧交叉在一起，一方面象征着塔大扎根边疆的“胡杨精神”，一方面它们紧紧缠绕就像拥抱在一起的石榴籽。