弘治五年（1492）举人，正德六年（1511）进士，授浦城知县，擢南京吏科给事中。御史张经、宁波知府翟唐得罪宦官被捕，孙懋和同僚上书救援。织造太监史宣诬告主事王銮、知县胡守约，将他们打入诏狱。孙懋进言：“宣妄言御赐黄棍，听挞死官吏，胁主簿孙锦死，今又诬守职臣。乞治宣罪，还銮、守约故任。”不久，又和诸给事中进言：“臣等屡建白，不择可否，一概留中。万一奸人阴结党类，公行阻遏，朝有大事，陛下不闻，大臣不知，祸可胜言！”皆不报。已，又弹劾罢免盐法侍郎薛章，请求罢免太仆少卿马陟，留任御史徐文华，召还谢迁、韩文、孙交、张原、周广、高公韶、王思等，罢游畋射猎，复御朝常仪，还久留边兵，淘汰锦衣卫冗官，诸疏皆侃侃。江彬引导明武宗巡幸。孙懋进言：“彬枭桀憸邪，挟至尊出居庸关，无大臣保护，独处沙漠将半载。两宫违养，郊庙不亲，四方灾异迭见，盗贼蜂起。留彬一日，为宗社一日忧，乞立置重典。”此时，内外章奏，明武宗一并不省视。规主阙者，往往得无罪。一触权幸，祸立至，人皆为孙懋感到危险。而江彬每日跟随明武宗娱乐，亦不之见也。孙懋参与请求明武宗回銮，谏阻明武宗南巡。朱宸濠反，明武宗在南京，孙懋从行。请求急定平贼功赏，又数次请求明武宗还京，率同官伏阙，皆不省。