退役：1845年，移交给海岸警卫队

结局：1870年解体售出

1831年12月是贝格尔号第二起航，菲茨·罗伊舰长要为测量大地岛的南岸去作一次旅行，然后要访问南海中的许多岛屿，再经印度群岛返航。历时五年，从英格兰出发，穿越北大西洋到达南美洲，沿着南美洲的西岸航行，绕过南美洲的合恩岛后后进入南太平洋，再沿着南美洲的南岸航行，然后驶向加拉帕戈斯岛，之后再向南半球出发，到达澳洲的悉尼，沿着澳洲的南岸行驶到达霍巴特（澳大利亚塔斯马尼亚岛东南岸港市），绕过澳洲后进入印度洋，绕道非洲的好望角进入北大西洋回英国。伟大的生物学家，进化论的创始人达尔文乘此船进行科学考察。

贝格尔号上有两个尉官：季·韦克姆和布·谢利万，一名医生，十名军官，一名水手长，四十二名水兵 和八名少年见习水手。此外，舰上还应有一名博物学家（查理·达尔文），其次还有一个专门看管仪表、天文钟和其他仪器的人，一名美术家和一名绘图员埃尔德，一名曾去过火地岛的传教士和三名火地岛人。

这次探险的任务之一是研究和详细勘察南美洲的东西两岸。但是政治和经济任务则是这次航行的基本原因。当时的英 国，力求夺取南美洲的市场，力求促使英国的资本渗透到这个洲的各个国家的经济中去。因此，这次探险的所谓科学目的，只是英国用来掩盖自己在南美洲进行扩张的一个最方便的借口而已。贝格尔号于1831年12月27日扬帆起航，绕地球一圈，于1836年10月2日回到英国。达尔文沿途考察地质、植物和动物，采集了无数标本运回英国，还未回国就已在科学界出了名。这5年的见识，让达尔文从一名正统的基督徒变成了无神论者，不可能再去当牧师了，成了职业博物学家。更重要的是，他开始思考生物的起源问题，最终创建了进化论，极大地改变了世界。种种巧合促成的贝格尔之航是达尔文人生的转折点，也是人类历史的转折点。

该舰舰长菲茨.罗伊是“标准的”军官，更是虔诚的教徒，爱真理更爱上帝。所以达尔文的《物种起源》出版后，他愤怒地宣称达尔文背叛了自己。在著名的牛津论战中，他手捧《圣经》，高喊“圣书啊！圣书啊！”离开会场。最后因精神错乱而自杀。

达尔文随“贝格尔号”航行历程一览表

英国海军有多种重型船舶，“贝格尔号”是其中之一。达尔文的环球航行之后，“贝格尔号”被交给了海关，它被用作监视船，暗中监视那些利用隐蔽水域逃脱关税的海岸走私者-他们的货物主要包括织物、烟草、白兰地，以及其他来自大陆的货物。用于在艾塞克斯海滨缉捕走私犯。许多年间，“贝格尔号”一直泊在罗切河（Roach）中流，先后有几家海岸警卫在此居住。1870年，船龄50年的“贝格尔号”被卖给了一个当地废品商，有关它的记录也就戛然而止。不过，这家废品公司在罗切河上有一个码头。正是在这个码头所在的位置，科学家们找到了一艘疑为“贝格尔号”的沉船。

作为科学史上最重要文物之一的“贝格尔号”却在100多年前就已下落不明，成为了考古学上的一个谜。英国的一队海洋考古工作者在艾塞克斯的沼泽中发现了一艘沉船，它被厚约4米的淤泥所覆盖。尽管科学家们掌握的材料只是船体的雷达图像，但他们相信这很可能就是人们苦苦寻觅的“贝格尔号”。“贝格尔号”研究小组成员、圣安德鲁斯大学的罗伯特·普雷斯科特说：“我们对相关线索进行了仔细研究，最后才找到了这个地点。”

科学家们将对沉船作进一步研究以确定其真实身份，但他们还不知道应该怎样处理这一发现。普雷斯科特说：“目前，我们还不打算把它打捞上来进行保存。实际上，在确定它就是‘贝格尔号’之后，我们也只能就此罢手。不过，搜寻船里剩下的物品将是一件很有意思的事情。那里可能会有曾装在达尔文口袋里的硬币，甚至还可能有他采集的昆虫标本所留下的蛛丝马迹。”