张孝骞早年在美国进行人体血容量研究。回国后继续血容量研究，对甲状腺机能亢进、肾病、营养不良性水肿等病的血容量作了探索。其后研究重点转入消化系统，创建国内第一个临床消化专业小组，用组织胺方法对健康和患病时的胃分泌功能作了详细探讨，包括正常值、贫血、维生素A缺乏、热病等对胃酸的影响；还对阿米巴痢疾、溃疡性结肠炎、结核性腹膜炎、消化性溃疡等，均有系统的研究和创见。

截至1987年8月，张孝骞在中国国内外杂志上发表有关消化、代谢、血液等方面的医学论文50余篇。其他论著部分参考如下：

[1]董恩钰，石健民，贝濂，等.超声显象在胰腺疾病诊断中的应用[J].实用内科杂志，1984（2）

[2]虞重坚，张孝骞，陈敏章，等.测定血清胃泌素的临床意义[J].中国医学科学院学报，1982（6）

[3]张孝骞.基础、临床、社会实践—和首都医大学生谈如何学临床医学[J].医学与哲学，1982（09）：5-6.

[4]张孝骞.谈谈疾病的诊治—附一例的诊断经过[J].实用内科杂志，1982（1）.

[5]余光明，张孝骞.醋唑磺胺（Diamox）引起急性肾功能衰竭[J].北京医学，1981.

[6]陈寿波，张孝骞.Behcet氏病的一些特殊临床表现（摘要）[J].中国医学科学院学报，1980（1）.

[7]张孝骞，朱预，刘彤华，等.间叶瘤合并抗维生素D的低血磷软骨病一例报告[J].中华医学杂志1980年60卷3期,

[8]张孝骞.临床医生要讲究思想方法的修养[J].中国医院，2003，007（004）：27-28.

[9]张孝骞.临床医生要讲究思想方法的修养[J].临床误诊误治，1996.

[10]张孝骞.中国医学百科全书.40，免疫性疾病.41，风湿病学[M].上海科学技术出版社，1992.

[11]张孝骞，邓家栋.内科学及护理[M].人民卫生出版社，1961.

[12]张孝骞.临床医生要讲究思想方法的修养[J].中国医院，1996，7（3）：27-28.

[13]张孝骞.漫谈临床思维[J].医学与哲学，1984（02）：3-7.

张孝骞先后创建了中国第一个消化专业组，第一个消化专科。

张孝骞培养的学生大多成为中国医疗骨干，如北京协和医院内科学陈寿坡教授，北京协和医院内科学罗慰慈教授，北京协和医院神经内科学汤晓芙教授，生理学家徐有恒教授，中南大学湘雅医学院彭隆祥教授，中南大学湘雅二医院伍汉文教授等。

张孝骞的祖父张泽邕，办起家庭作坊，凭一台石碓舂米出售，换取微薄收入。张孝骞的父亲张浚远，是一名中学教师。6岁时，祖父就将张孝骞送到私塾，读的是四书五经，让他有了古文典籍的功底。张孝骞弟妹多，全家十多口人，二妹长期生病，家庭生活困难。

张孝骞的妻子是周淑莲；张孝骞的长子是生物化学与分子生物学家张友尚院士，张友会是其小儿子。

“张孝骞是中国现代医学先驱，是卓越的临床医学家、医学科学家和医学教育家，中国现代胃肠病学创始人，对内科学系建设、人才培养、医学教育和临床实践倾注了全部心血，为发展内科综合实力作出卓越贡献。”（科学网评）

“张孝骞是中国西医学的先驱、著名临床医学家，他是‘协和’泰斗、‘湘雅’轩辕。”（《光明日报》评）

“张孝骞是著名内科专家、医学教育家、中国消化病学的奠基人。”（中国散文学会副会长韩小蕙评）

“张孝骞是中国杰出的临床医学家、教育家，他医术精湛，治学严谨，一生更是鞠躬尽瘁，作丝为茧，为湘雅的建设和发展做出了不可磨灭的贡献。”（ 中南大学评）

中国邮政自1988年开始发行《中国现代科学家》系列邮票，截至2020年9月，共发行了八组，34位科学家入选。1992年张孝骞入选第三组纪念邮票。

2018年，中南大学湘雅二医院设立了“张孝骞大讲坛”，以传承张孝骞“如履薄冰，如临深渊”的行医理念，将“求真求确，必邃必专”的湘雅精神发扬光大。

2021年10月18日，舞台剧《张孝骞》在中南大学首演，《张孝骞》以湘雅首届毕业生张孝骞求学湘雅，带领湘雅西迁，护佑湘雅的事迹为主线，串联起历史上众多湘雅先贤与进步人士的英雄群像，铺展湘雅医学的建设“史卷”。

张孝骞雕像矗立于湘雅医学院河东校区校园内。

在湘雅医学院河西校区校园内建有历史文化长廊先贤墙，张孝骞的浮雕像就置于先贤墙中。

湘雅医学院河西校区教研楼命名为“孝骞楼”。