他是一位博览群书的学者，勇于思考，往往能够摆脱传统思想的束缚，揭示隐微，提出异议。所著书多种，而“《千百年眼》盛传于世”，其价值曾经得到王夫之、阮元等学术大家的肯定。 康熙将此书列为头禁书，自己却终生秉烛攻读不辍。

《千百年眼》是一部史论随笔的合集。全书十二卷，511条，其中新义纷呈，体现出作者读史“不为苟同”的风格。又大多言之有据，有些见解确如邹元标《千百年眼序》所说，“起古人相与论辩，亦必心服。”此书上起远古，下迄明季，涉及政治、军事、经济、文教、科技，还有许多为正史所不载的逸闻轶事。记述具体，议论新奇。正如书名所示，作者想要看透千百年来中国的历史。