1986年1月，担任首都医科大学附属北京儿童医院小儿外科特级专家、教授、博士生及博士后导师。

1997年，当选中国工程院院士。

2011年，担任北京胡亚美儿童医学研究院院长。

2022年12月24日17时03分，张金哲院士因病医治无效在北京逝世，享年102岁。

张金哲首先发现了当时死亡率最高的新生儿皮下感染，并命名为“婴儿皮下坏疽”，使该病得到有效控制；20世纪50—80年代在以创伤、感染、急腹症为主的小儿外科急症的诊断、治疗，及肛肠外科与胆道外科方面手术设计方面作出了成就和贡献，为中国小儿外科迅速发展并在国际上享有特殊地位起了一定的作用。

根据2020年3月首都医科大学附属北京儿童医院网站显示，张金哲先后发表论文300余篇，主编及参与著书50余部。

根据2020年3月首都医科大学附属北京儿童医院网站显示，张金哲先后获得省部级以上的科技进步奖10多项，各项发明50余项。

张金哲的治学之道是团结中国国内同道，引进中国国外先进技术，针对中国国内现实加以改造，目标是向全国推广，扶持各地专职或非专职小儿外科同道提高技术标准。

张金哲对医德的内涵有进一步的思考。他说，一个医生微笑服务、礼貌待人，这是最基本的要求，是在小学阶段就应该培养的基本素质，如果医院的院长现在还把这专门提出来，要求就太低了。医德应是更深层的内容。 张金哲常对学生们说，做医生的最大的医德就是尽心尽力把病人的病治好。医生不管水平多高，也要牢记自己永远是个服务者，可现在有的大夫给病人看病像审小偷似的，所以他认为必须要取消终身制、铁饭碗，让医生重新进入到自由职业的行列。

1958年，张金哲受中华人民共和国卫生部委托，开办了一年制中国小儿外科医师培训进修班，其学员后来多成为各地小儿外科骨干。张金哲为首都医科大学儿科系近千名本科生讲授小儿外科学。

根据2020年3月首都医科大学附属北京儿童医院网站显示，张金哲先后培养了数百名小儿外科医生和近20名硕士、博士、博士后研究生。

2023年12月24日，中国工程院院士张金哲逝世一周年之际，为了传承和发扬他仁爱与奉献的精神，张金哲院士嫡孙张传俯作为发起人及委托人，在各方支持下，在北京成立“张金哲院士慈善信托”。

张金哲是中国小儿外科创始人之一，直至90多岁高龄仍然躬身临床为小儿解决病痛。行医多年，对患儿呵护有加，凡遇患儿问诊必先起身，听诊器焐热再轻放在患儿胸前，每逢患儿哭闹，他就像魔术师一样从白大褂口袋里摸出小物件吸引患儿，待孩子平静后再行诊治。（新华网评）

1950年张金哲首先在中国国内北大医院创建了小儿外科，成为中国小儿外科创始人中声望最高的一个。1955年起在新建的北京儿童医院外科大展鸿图，从无到有，从小到大，创建和完善了全国最大的小儿外科中心；与此同时在医学实践与研究、医学创新、医学教育、小儿外科学会与专业杂志、中国国内外学术交流与合作等方面均做出了突出的贡献。（首都医科大学附属北京儿童医院评）