宣德三年（1428），设剑南长官司（建南土司）等，皆以其酋长为之。先是忠路安抚司等各奏：前元故土官子孙牟酋蛮等各拥蛮民，久据溪洞，今就招抚，请设官司，授以事。帝以驭蛮当顺其情，所授宜有等杀，部议四百户以上设长官司，四百户以下设蛮夷官司元土官子孙量授以职。遂设剑南长官司，隶忠路安抚。

同年，忠路土司又派遣了一大批前元土官进贡：湖广前忠信军民府故土官知府覃吕啼送孙隆、前野王长官司土官长官田驴其什用子散鲁、前隆渠守镇诸峒蛮夷宣抚司故土官宣抚郎应隆子文、前镇南大奴峒宣抚司故土官宣抚田黑用子斌、前镇远安抚司故土官安抚苟候驴子向世雄、前顺化安抚司故土官安抚旺踵子墨言送、前九溪军民宣慰司故土官宣慰使墨迪送子古珠、前红奉峒安抚司土官安抚景先子木豪、忠路安抚司把事牟铭进等。

宣德五年（1430），湖广忠潞安抚司把事驴呼可宜备送等，及前大王狮壁洞忠义军民宣慰司舍人牟鉴、前龙渠宣抚司舍人郎文、前石金管坪等洞长官司舍人冉墨达送、南木答等来朝贡马及方物。

宣德七年（1432），忠路司奏：盘顺峒长向墨杓耸，为仰墨施前虎备等所杀；下散毛纳主峒土民驴拔送，为田大旺送等所杀，悉虏掠人口家财。

正统三年（1438），忠路安抚司遣舍人赴京贡马与方物。

（三）明中后期：不断壮大

正统六年（1441），朝廷命忠路安抚司安抚覃英之子覃亮代职。

正统十三年（1448），忠路安抚覃亮派遣把事谭仕财等赴京朝贡马匹，朝廷赐钞币。

景泰三年（1452），忠路安抚司猺把等峒舍人向猺把等赴京贡马，朝廷赐钞锭。

天顺六年（1462），施州卫忠路安抚司把事仰启踵赴京贡马及方物。

成化二年（1466），忠路安抚司摇坝峒峒长向麦答踵奏：邻近洗罗峒长麦答洗褚等，窥知本峒土兵调征两广，村寨无备，扇动本峒原管上中下打撒蛮贼等攻围村寨，杀掳土民，劫掠财产，乞求官军惩治。

忠路土司与石柱土司本是姻戚，但因边界问题而构杀不休， 钟晓于嘉靖二年（1523）任归州知州， 成功平息忠路、石柱土司之争。

嘉靖十四年（1535），忠路安抚司遣人赴京朝贡，因过期，给半赏。

康熙元年（1662）覃承国归附，以征谭逆功，袭前职。

雍正十三年（1735）覃梓楚纳土，以其地改利川县。

洪武四年（1371）归顺明朝时司主。

永乐五年（1407）复设忠路安抚司时安抚使。

正统六年（1441），覃英致仕，覃英代职。 又名覃飞雄。

嘉靖九年（1530），施州贼黄马丫等百余人流劫云阳、万县、奉节、川东，道某知马丫与忠路为仇，檄安抚司覃正刚擒之。

隆庆元年（1567），吏科给事朱绘等言湖广施州卫忠路安抚覃大宁一日奏五言，上语多不实，请究治。

隆庆元年（1576）承袭。

在“平播之役”中施州各大小土司皆建有军功，唯覃寅化的请缨被朝廷拒绝，因为他与播州土司杨应龙有姻亲关系。“唯覃寅化一枝不可调，以其为杨应龙之亲也。”（明 李化龙《平播全书·卷十二》）

万历三十七年（1609），施州卫民牟海容等奏土酋覃寅化等劫杀荼毒，上命兵部看了来说。（《明神宗显皇帝实录·卷之四百五十五》） “万历四十一年（1613），安抚司覃寅化以占民田，相仇杀，抚夷章守愚檄指挥唐符勘立土汉界碑。”

“覃寅化，官都督，征四川余崇明有功。”（同治《恩施县志·卷之八》）

“剿贵州贼有功，加总兵忠路宣慰使”（同治《恩施县志·卷八》）

明崇祯年间，覃进孝承袭宣慰司职后，正逢李自成、张献忠领导的农民风起云涌，明王朝江山摇摇欲坠。覃进孝奉阁部杨嗣昌令，率兵到房县、竹山、襄樊等地参加镇压农民起义军的战争，后来在本地堵截过姚天幼、黄部，因此授总兵官挂威武上将将军印，晋爵忠义侯，加封太子少保。牟进孝夫人牟氏，诰封一品夫人。

顺治四年（1647）春谭文屯万县，谭弘屯夔府，谭诣屯巫山县，抵抗清军。覃进孝尽率忠路精锐，加入“三谭”的抗清队伍中。同时，覃进孝将次女嫁给了谭诣之子，将三女嫁给明凤卫侯牟文绶之子。

清朝定鼎后，覃进孝深感南明王朝大势已去，不可救药，遂于顺治十六年（1659年）随谭旨等降清，向川陕总督李国英呈缴明王朝授予的宣慰、宣抚等官印九颗。李国英认为忠路土司属湖北，因此令他回湖北。在归来途径三峡时，被夔东十三家起义军截住，覃进孝侥幸脱身，但印信全部失落。

覃进孝尚在渝东苦战时，清军血洗了忠路司，使忠路司“城廓丘墟，人烟断绝”，元气大伤。覃进孝回忠路后，心中十分悲怆，感伤之余，立即召聚同胞，整修衙署，祛却瘟疫，“立宗庙于颓垣，诛茅茨于署址，集哀鸿于中野，求故老于邻封阡陌之间”。

顺治八年（1651）秋，五十五岁的破山禅师来到忠路司，受覃进孝（字敦源）的邀请住进福田寺，当年冬离开忠路司。（《破山禅师语录》）

康熙元年（1662），覃承国归附，以征谭逆功，袭前职。

康熙十五年（1676），高峰三山来禅师至忠路司，宣抚覃公差官出迎，寓居楚藩寺，覃公率儿子藩楚，舍人殿吉、德美、莲臣，督军杨福从、蒲九韶、张士升，文学冉海清、王德迈，朝暮问道于禅师。（《高峰三山来禅师年谱》）

康熙三十二年（1693）。以湖广忠路安抚司土官覃承国子覃世藩袭职。

金字山寺曾有雍正元年（1723）钟，其中有铭文“湖广忠路军民安抚使司覃建侯”。

雍正九年（1731）。湖广总督迈柱题湖南忠路安抚司使覃建侯故，请以其子覃梓楚承袭，下部知之。

乾隆八年（1743），世袭千总覃梓楚，六年俸满，年富财优，由湖广总督阿尔赛奏请、大学士鄂尔泰议覆，送兵部予以升用。

据《嘉靖湖广图经志书》记载，明朝正德年间，忠路司有350户、共1530人，占施州总人口21291人的7%。

原忠路土司所辖范围，为现利川西部齐岳山、佛宝山外，麻山以西，除铜锣关、龙船（原支罗峒）外的广大地域。明宣德三年设建南土司，肢解了忠路土司的一部分领地。明天启年间设沙溪土司，又肢解了忠路土司的一部分领地。黔江区黎水乡有土城，明代时忠路土司曾诸城于此，故名。

忠路土司治所变动较大，据《施南府志》卷18载：“明弘治间，忠路、忠孝土司又徙施州都亭等里。”可知忠路土司治所最初并不在利川境内，传说初设于施州城南二龙坝（今宣恩县椒园镇老寨溪村），后迁旧司坝（今忠路镇丰乐村）、百战坡下的马家坝（今忠路镇田湾村），洪武二十三年（1390年）再徙于城池坝（今忠路镇农科村），万历四十一年（1613年），因内乱仇杀导致城池坝被毁，司治不得已又迁往忠路，至改土归流，司治忠路不曾再迁。《嘉靖湖广图经志书》记载了城池坝的建设过程：“成化间安抚覃德铭建，正德七年（1512）覃万勇重修。”

忠路土司在司城建有城隍庙，司城内有楚藩寺、城外有福田寺，

2013年在旧司坝（即忠路镇丰乐村）稻田中发现两尊石狮，身高1.2米，保存完好。经文物专家鉴定，认为是明代文物，并推测系土司请工匠打造的。但该文物不幸于2015年9月2日被盗，案件仍在侦破中。